More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4301 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  450  1e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  450  1e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  450  1e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  92.64 
 
 
231 aa  416  1e-115  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  92.64 
 
 
231 aa  414  1e-115  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  90.43 
 
 
230 aa  411  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.88235e-09  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.33 
 
 
228 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  82.46 
 
 
228 aa  348  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  79.48 
 
 
229 aa  330  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  71.93 
 
 
227 aa  322  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.95 
 
 
228 aa  322  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.35 
 
 
229 aa  304  9e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  72.44 
 
 
234 aa  297  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  59.58 
 
 
246 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.84 
 
 
229 aa  275  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  60 
 
 
237 aa  265  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  62.17 
 
 
235 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.22 
 
 
238 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 
228 aa  253  1e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.89 
 
 
223 aa  252  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  55.9 
 
 
228 aa  248  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.7 
 
 
225 aa  243  2e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.01655e-08 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  59.13 
 
 
226 aa  241  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.19 
 
 
224 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.74 
 
 
254 aa  238  6e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 
224 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  54.26 
 
 
224 aa  235  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.02 
 
 
242 aa  234  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  3.87016e-06 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  55.8 
 
 
232 aa  234  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 
224 aa  231  7e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  50.67 
 
 
236 aa  230  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  53.57 
 
 
224 aa  230  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 
225 aa  229  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  2.06018e-08 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.23 
 
 
223 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.64 
 
 
223 aa  228  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 
239 aa  228  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 
240 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.11909e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 
406 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 
273 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 
236 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 
235 aa  225  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
233 aa  225  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 
240 aa  225  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  51.09 
 
 
257 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
226 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  48 
 
 
223 aa  221  5e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
255 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48 
 
 
224 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 
238 aa  220  1e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
242 aa  219  2e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
229 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
224 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  48 
 
 
224 aa  219  4e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 
225 aa  218  4e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.67 
 
 
271 aa  218  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 
246 aa  218  8e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
224 aa  218  9e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.34276e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
239 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
239 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 
225 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 
248 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
239 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  50.22 
 
 
247 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  52 
 
 
243 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  52 
 
 
243 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  52 
 
 
243 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.44 
 
 
238 aa  216  3e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 
244 aa  216  3e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 
224 aa  215  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 
223 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 
223 aa  215  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  4.06961e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  50.22 
 
 
233 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 
244 aa  214  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 
248 aa  213  2e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
233 aa  213  2e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  49.56 
 
 
252 aa  213  3e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 
224 aa  212  4e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.98 
 
 
236 aa  212  4e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 
224 aa  212  5e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
236 aa  212  5e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  50.67 
 
 
233 aa  212  5e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  55.95 
 
 
233 aa  212  5e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  48 
 
 
241 aa  211  8e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
238 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
224 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
236 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.44 
 
 
229 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 
231 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 
224 aa  208  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 
224 aa  208  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  47.58 
 
 
235 aa  208  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 
232 aa  207  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.84 
 
 
239 aa  207  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
232 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 
227 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.22 
 
 
254 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 
227 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 
227 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 
225 aa  206  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>