64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0468 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  100 
 
 
422 aa  815    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  100 
 
 
422 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  100 
 
 
422 aa  815    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  59.2 
 
 
431 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  60.87 
 
 
369 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  59.79 
 
 
406 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  60.96 
 
 
443 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  60.96 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  60.96 
 
 
443 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  57.29 
 
 
428 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  57.29 
 
 
428 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  57.29 
 
 
428 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  56.16 
 
 
438 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  56.16 
 
 
438 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  56.16 
 
 
438 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  44.15 
 
 
570 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  40.31 
 
 
398 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  39.78 
 
 
417 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  40.99 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  32.89 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  30.73 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  34.1 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  35.76 
 
 
402 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  34.38 
 
 
420 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  35.33 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.26 
 
 
444 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.42 
 
 
467 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  32.32 
 
 
408 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  33.8 
 
 
425 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  32.24 
 
 
469 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  31.48 
 
 
418 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  31.02 
 
 
418 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  31.02 
 
 
418 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  33.02 
 
 
455 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  31.68 
 
 
427 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  33.88 
 
 
428 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  32.39 
 
 
430 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  30.83 
 
 
494 aa  99.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.45 
 
 
411 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  34.07 
 
 
478 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  34.08 
 
 
470 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  30.59 
 
 
479 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  31.83 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  31.25 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  31.25 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  30.6 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  29.5 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  29 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  29.63 
 
 
477 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  32.45 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  33.92 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  31.27 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  27.81 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  27.9 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  31.94 
 
 
463 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  30.72 
 
 
419 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  25.9 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  26.76 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  31.29 
 
 
375 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  28.41 
 
 
431 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.32718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  31.25 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_002950  PG1782  hypothetical protein  25 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  28.9 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  29.01 
 
 
469 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>