More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0263 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 452 aa  917    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  52.1 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  54.7 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  52.21 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  52 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  53.02 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 		 454 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  53.41 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  53.81 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  52.46 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  52.15 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  52.89 
 
 		 466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  51.56 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  52.14 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  52.14 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 453 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  51.92 
 
 		 452 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  49.44 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  46.39 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  47.49 
 
 		 454 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  45.7 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0406  DNA repair protein RadA  51.95 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  54.06 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 453 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  52.36 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  51.03 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  52.36 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  51.34 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  51.34 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 476 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  48.97 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  48.97 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 449 aa  428  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  52.13 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  51.37 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  51.71 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 		 452 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  51.62 
 
 		 477 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  50.79 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  48 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  49.2 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  51.83 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  45.31 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  50.45 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  45.95 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  51.73 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  51.75 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2291  DNA repair protein RadA  48.7 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284518  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3941  DNA repair protein RadA  53.15 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1784  DNA repair protein RadA  50.56 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  51.35 
 
 		 477 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  49.01 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  49.46 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  52.09 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 456 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  46.36 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  46.36 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  49.66 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  49.46 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  48.46 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1207  DNA repair protein RadA  50.68 
 
 		 458 aa  415  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  49.32 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 		 464 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>