More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0169 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 422 aa  865    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  69.78 
 
 		 431 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  69.3 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  69.54 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  65.81 
 
 		 434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  67.38 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  65.81 
 
 		 434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 		 434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  65.62 
 
 		 434 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  65.48 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  65.94 
 
 		 422 aa  559  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 		 438 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  66.51 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  64.34 
 
 		 432 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  65.48 
 
 		 439 aa  553  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  64.34 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  63.94 
 
 		 437 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  64.45 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  64.34 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  64.1 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  64.01 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  63.37 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 424 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 		 436 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  65.14 
 
 		 413 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 		 424 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  63.16 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  62.92 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  64.05 
 
 		 420 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  64.05 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  63.07 
 
 		 424 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  64.03 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  64.03 
 
 		 433 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 424 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  62.83 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 424 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 438 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 424 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  65.95 
 
 		 451 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 424 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  62.83 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 424 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 438 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  63.04 
 
 		 424 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  61.85 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  64.03 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  62.83 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  66.27 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  66.27 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  63.42 
 
 		 424 aa  534  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  64.01 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  62 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 424 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  62.89 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  62 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  62.89 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  62 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  62 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 417 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  64.1 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 423 aa  531  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  62.74 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 424 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 		 432 aa  532  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 417 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 418 aa  529  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 416 aa  529  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  63.01 
 
 		 417 aa  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 		 416 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  62.89 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  63.72 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  63.13 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 418 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 		 418 aa  526  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>