More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0041 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  95.08 
 
 
184 aa  349  1e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  80.87 
 
 
183 aa  308  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  66.85 
 
 
201 aa  257  7e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  66.85 
 
 
199 aa  254  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  56.91 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  58.24 
 
 
183 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  58.24 
 
 
183 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  55.49 
 
 
181 aa  208  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  53.67 
 
 
180 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  53.59 
 
 
191 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  50 
 
 
201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  47.54 
 
 
189 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  48.11 
 
 
190 aa  174  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 
199 aa  174  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  50.82 
 
 
187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  47.03 
 
 
194 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  47.03 
 
 
189 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  44.51 
 
 
219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  46.52 
 
 
309 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 
307 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 
307 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  46.74 
 
 
197 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 
196 aa  158  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  44.68 
 
 
194 aa  157  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  46.74 
 
 
198 aa  157  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 
194 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  44.26 
 
 
201 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.96 
 
 
182 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  44.51 
 
 
206 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  44.44 
 
 
228 aa  153  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  46.24 
 
 
192 aa  152  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  46.37 
 
 
209 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  44.86 
 
 
197 aa  151  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  46.96 
 
 
185 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  46.96 
 
 
185 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  45.86 
 
 
188 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  44.75 
 
 
185 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  44.81 
 
 
197 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  45.45 
 
 
201 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  46.11 
 
 
194 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  45.99 
 
 
201 aa  148  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  44.75 
 
 
188 aa  148  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  50.61 
 
 
176 aa  147  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  43.17 
 
 
186 aa  147  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  46.49 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  46.49 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  43.33 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  43.33 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 
202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.47 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.47 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.47 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  40.53 
 
 
224 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  46.59 
 
 
189 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  43.09 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  44.07 
 
 
188 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  42.16 
 
 
184 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  42.16 
 
 
188 aa  141  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 
193 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.77 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  40.22 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  46.33 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.24 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.24 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 
189 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  45 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.45 
 
 
184 aa  137  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  43.58 
 
 
184 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 
201 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  42.05 
 
 
189 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  38.07 
 
 
183 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  47.54 
 
 
184 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  39.25 
 
 
191 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  40.88 
 
 
185 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  46.74 
 
 
196 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  42.78 
 
 
184 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 
185 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  42.76 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  48.07 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  43.83 
 
 
186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  39.34 
 
 
199 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  39.89 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  39.89 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  39.89 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  38.71 
 
 
199 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  45.32 
 
 
190 aa  131  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 
203 aa  131  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 
194 aa  130  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>