More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0055 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0055  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 
224 aa  446  1e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1150  hydrogenase accessory protein HypB  97.32 
 
 
224 aa  434  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.922491  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0768  hydrogenase accessory protein HypB  96.43 
 
 
224 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0833  hydrogenase accessory protein HypB  86.16 
 
 
227 aa  371  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1020  hydrogenase accessory protein HypB  75 
 
 
220 aa  332  3e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  51.12 
 
 
222 aa  227  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1515  hypothetical protein  51.42 
 
 
215 aa  212  3e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  50.47 
 
 
215 aa  208  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  49.07 
 
 
215 aa  204  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.734472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0470  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 
215 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2308  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 
215 aa  196  2e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  37.21 
 
 
326 aa  171  6e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  39.02 
 
 
301 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  40.48 
 
 
293 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2335  hydrogenase accessory protein HypB  46.83 
 
 
297 aa  169  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  38.89 
 
 
286 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  40.09 
 
 
307 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  37.8 
 
 
268 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  37.62 
 
 
225 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  36.99 
 
 
276 aa  165  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  36.2 
 
 
277 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  38.36 
 
 
312 aa  164  7e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  34.11 
 
 
225 aa  164  1e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  36.07 
 
 
294 aa  164  1e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  34.76 
 
 
224 aa  163  2e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  36.54 
 
 
242 aa  163  2e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  37.61 
 
 
250 aa  162  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  37.5 
 
 
321 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  40.1 
 
 
278 aa  162  5e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  36.94 
 
 
283 aa  162  5e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.62 
 
 
303 aa  161  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  38.57 
 
 
267 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 
244 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.74081e-12  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  36.27 
 
 
222 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  38.57 
 
 
266 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  33.17 
 
 
224 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  40.49 
 
 
269 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  41.58 
 
 
252 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  38.07 
 
 
279 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.84 
 
 
290 aa  158  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  37.04 
 
 
284 aa  158  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  35.89 
 
 
218 aa  158  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.84 
 
 
290 aa  157  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.84 
 
 
290 aa  157  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.84 
 
 
290 aa  157  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.84 
 
 
290 aa  157  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  36.84 
 
 
290 aa  157  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  36.84 
 
 
290 aa  157  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  36.84 
 
 
290 aa  157  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  39.05 
 
 
254 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  41.43 
 
 
318 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  39.42 
 
 
277 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  38.5 
 
 
253 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  37.5 
 
 
300 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.36 
 
 
290 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.36 
 
 
290 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.84 
 
 
290 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.36 
 
 
290 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  37.96 
 
 
260 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  35.35 
 
 
292 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.36 
 
 
290 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  38.94 
 
 
264 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  37.26 
 
 
253 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  35.41 
 
 
220 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  39.11 
 
 
295 aa  156  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  35.81 
 
 
300 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  37.73 
 
 
254 aa  155  5e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  34.38 
 
 
352 aa  155  5e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  37.75 
 
 
296 aa  155  5e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  37.56 
 
 
269 aa  154  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  7.96055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  39.62 
 
 
407 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  38.76 
 
 
244 aa  154  9e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  37.09 
 
 
270 aa  154  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  38.76 
 
 
263 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  34.7 
 
 
227 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  35.55 
 
 
322 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  33.48 
 
 
234 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  38.28 
 
 
268 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  37.61 
 
 
264 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  36.84 
 
 
323 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  39.11 
 
 
262 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  39.42 
 
 
253 aa  152  3e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  34.93 
 
 
257 aa  152  3e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  41.82 
 
 
268 aa  152  3e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 
290 aa  153  3e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  32.84 
 
 
218 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  34.93 
 
 
305 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  38.12 
 
 
270 aa  152  6e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  39.42 
 
 
253 aa  151  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  36.14 
 
 
303 aa  151  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  33.49 
 
 
273 aa  151  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  37.2 
 
 
270 aa  151  9e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  36.23 
 
 
218 aa  151  9e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  38.03 
 
 
281 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  36.49 
 
 
283 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  34.82 
 
 
315 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  37.14 
 
 
258 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  33.47 
 
 
345 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  38.03 
 
 
277 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.79 
 
 
252 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>