More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0208 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  795    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  65.33 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  64.8 
 
 		 375 aa  495  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  62.5 
 
 		 377 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  62.4 
 
 		 376 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  50.66 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  48.92 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  48.14 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  45.43 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  45.17 
 
 		 382 aa  323  4e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.39 
 
 		 382 aa  315  9e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  43.72 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  42.52 
 
 		 387 aa  285  8e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  40.89 
 
 		 383 aa  265  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  40.83 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  40.83 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  40.57 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  37.13 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  38.07 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  40.46 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  40.48 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  38.81 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  41.14 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  38.96 
 
 		 385 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  38.68 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  39.5 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.89 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  38.77 
 
 		 379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.04 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  37.29 
 
 		 360 aa  233  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  35.01 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  36.79 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  36.34 
 
 		 384 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  39.29 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  36.34 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  38.5 
 
 		 379 aa  229  9e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.4 
 
 		 400 aa  229  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  37.23 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  37.43 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  34.22 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  36.32 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  38.93 
 
 		 380 aa  225  9e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.5 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  40.1 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  37.97 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  38.46 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  35.28 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  38.24 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  36.74 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  36.74 
 
 		 362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  38.19 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  35.42 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  36.93 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  34.2 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.74 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  34.9 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  34.37 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  35.36 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  31.61 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  34.03 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  32.7 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  31.65 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  32.61 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  31.96 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  32.47 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  34.21 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  34.69 
 
 		 373 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  34.37 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  35.58 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  32.83 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  34.26 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  32.55 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  34.26 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  31.51 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  33.75 
 
 		 402 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  31.76 
 
 		 403 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  33.52 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  31.54 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  34.3 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  32.73 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  32.11 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  32.31 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  32.39 
 
 		 421 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  31.28 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  30.32 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  31.46 
 
 		 396 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  31.69 
 
 		 417 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  31.77 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  33.43 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  31.97 
 
 		 414 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  30.88 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  31.07 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  30.64 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  31.28 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>