More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2389 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  100 
 
 
318 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  95.91 
 
 
318 aa  620  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  92.77 
 
 
318 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  92.77 
 
 
318 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  92.77 
 
 
318 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  76.1 
 
 
318 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  55.1 
 
 
318 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  51.59 
 
 
318 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  52.35 
 
 
317 aa  325  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  51.72 
 
 
317 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  52.23 
 
 
318 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  52.23 
 
 
318 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  52.23 
 
 
318 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  42.38 
 
 
309 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.02 
 
 
302 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  36.62 
 
 
311 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  40.82 
 
 
304 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  38.24 
 
 
309 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  38.24 
 
 
309 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  37.93 
 
 
309 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  38.61 
 
 
304 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  38.68 
 
 
304 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.54 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  38.54 
 
 
301 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  38.73 
 
 
309 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  41.43 
 
 
283 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  40.13 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  39.73 
 
 
296 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  31.51 
 
 
309 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  34.28 
 
 
300 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  39.3 
 
 
301 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  33.22 
 
 
306 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
329 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  43.66 
 
 
143 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  31.08 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.82 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.8 
 
 
333 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  22.45 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.79 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  31.82 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.72 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  30.2 
 
 
372 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  28.48 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.02 
 
 
328 aa  87  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.37 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.9 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.86 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  26.06 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  32.98 
 
 
321 aa  85.9  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.18 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.17 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  28.74 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.23 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  27.84 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.78 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  32.79 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  32.74 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.96 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  28.68 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  25.89 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.15 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  27.53 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  28.65 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  28.65 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.06 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  28.65 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  25.67 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  26.67 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  31.76 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  32.29 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.12 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  30.77 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.97 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.05 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25.98 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  25.93 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  26.64 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  25.42 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.6 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  24.26 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  24.26 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  24.26 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  28.11 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  31.25 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  28.11 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  25.38 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.43 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  29.52 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  26.84 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  26.04 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  25.42 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  30.73 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>