More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3106 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  100 
 
 		 250 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  94.8 
 
 		 250 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  87.55 
 
 		 250 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  70.2 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  64.88 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  70.08 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  45.93 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  50.43 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  47.92 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  50.85 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  47.93 
 
 		 259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  40.33 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  48.31 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  48.15 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  38.27 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  39.68 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  40.82 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  39.51 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  39.51 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  43.92 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  44.44 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  45.27 
 
 		 265 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  38.68 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  39.04 
 
 		 253 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  37.77 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  36.44 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  39.04 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  39.18 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  35.22 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  40.65 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  37.8 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  42.08 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  34.65 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  32.05 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  26.94 
 
 		 330 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  31.2 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  38.96 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  37 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  32.07 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  35.68 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  39.34 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  35.02 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25.53 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  33.48 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.96 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  30.54 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  31.36 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  31.25 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  30.64 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  28.87 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  30.93 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  27.95 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  29.1 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  29.75 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  27.27 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  26.79 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  33.81 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  24.5 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  32.09 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  26.27 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  24.49 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  23.61 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  25.33 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  25.33 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  22.94 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  32.73 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  29.55 
 
 		 438 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  24.69 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.35 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  24.08 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  24.7 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  25.1 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  25.1 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  27.87 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  21.52 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  24.69 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  24.69 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.86 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  24.69 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  30.58 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  22.84 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  24.28 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  24.28 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  26.54 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  23.89 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  23.89 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  25.1 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  22.75 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  22.84 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  21.5 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  21.37 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  25.21 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  24.89 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  25.11 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  23.5 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  21.7 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  31.46 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  37.96 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>