More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4464 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4464  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
299 aa  603  1e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0196  dihydrodipicolinate synthetase  60.35 
 
 
307 aa  337  2e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5532  dihydrodipicolinate synthetase  55.97 
 
 
301 aa  314  1e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5443  dihydrodipicolinate synthetase  46.08 
 
 
317 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344282  hitchhiker  0.00661581 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5174  dihydrodipicolinate synthetase  44.71 
 
 
317 aa  221  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0202491  normal  0.065211 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3336  dihydrodipicolinate synthetase  42.16 
 
 
303 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4216  dihydrodipicolinate synthetase  42.44 
 
 
320 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0462427  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0033  dihydrodipicolinate synthetase  34.81 
 
 
305 aa  135  6e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4210  dihydrodipicolinate synthetase  28.43 
 
 
319 aa  128  1e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4436  dihydrodipicolinate synthetase  28.76 
 
 
311 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0722382  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4457  dihydrodipicolinate synthetase  28.38 
 
 
312 aa  117  2e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0032522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4039  dihydrodipicolinate synthetase  31.21 
 
 
321 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31.43 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1084  dihydrodipicolinate synthetase  31.65 
 
 
301 aa  99  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00262766  hitchhiker  0.00208818 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1030  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  32.23 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113729  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 
290 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.6647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.12 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.34 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  29.19 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5701  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.08 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4201  dihydrodipicolinate synthetase  29.29 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 
291 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  33.03 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  26.94 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1947  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.25 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2020  dihydrodipicolinate synthetase  27.89 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  29.69 
 
 
299 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  31.64 
 
 
309 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 
291 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  32.48 
 
 
310 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.17 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0788  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.049848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  30.26 
 
 
294 aa  84.7  1e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  29.26 
 
 
295 aa  85.1  1e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  29.26 
 
 
295 aa  85.1  1e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3337  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  32.64 
 
 
301 aa  85.1  1e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 
297 aa  85.1  1e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1689  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.31 
 
 
308 aa  84.7  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448176  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1875  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.46 
 
 
307 aa  84.3  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207996  normal  0.131652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5157  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.02 
 
 
321 aa  84.3  2e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414541  hitchhiker  0.0087046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0755  dihydrodipicolinate synthetase  29.73 
 
 
311 aa  84  3e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  26.98 
 
 
303 aa  83.6  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5345  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.36 
 
 
301 aa  84  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 
298 aa  83.6  4e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  26.95 
 
 
293 aa  83.2  4e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1718  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.89 
 
 
301 aa  82.8  6e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
297 aa  82.8  7e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3688  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  25.68 
 
 
304 aa  82  1e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  30.64 
 
 
293 aa  82  1e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 
297 aa  82  1e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 
291 aa  81.6  1e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3655  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.08 
 
 
301 aa  82  1e-14  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  32.82 
 
 
307 aa  82  1e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 
291 aa  81.3  2e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 
291 aa  80.9  2e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7513  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.73 
 
 
326 aa  81.3  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4736  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  25.34 
 
 
304 aa  80.9  2e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  33.63 
 
 
291 aa  81.6  2e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
296 aa  80.9  2e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 
326 aa  80.5  3e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3599  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  25 
 
 
303 aa  80.5  3e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815897  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 
303 aa  80.9  3e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 
296 aa  80.5  3e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3393  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.74 
 
 
301 aa  80.5  3e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3098  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  25 
 
 
303 aa  80.9  3e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  28.88 
 
 
293 aa  80.1  4e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  27.3 
 
 
292 aa  80.1  4e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  27.66 
 
 
292 aa  80.1  4e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 
292 aa  80.1  4e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.02013e-05  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 
292 aa  80.1  4e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  25 
 
 
303 aa  80.1  4e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612252  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
298 aa  80.1  4e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  28.91 
 
 
291 aa  79.7  5e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 
294 aa  79.7  5e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 
296 aa  79.7  5e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  25.42 
 
 
294 aa  79.7  5e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 
296 aa  79.7  6e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  27.17 
 
 
294 aa  79.7  6e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.0244e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1215  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.09 
 
 
303 aa  79.3  6e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  27.55 
 
 
291 aa  79.3  7e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05220  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.84 
 
 
303 aa  79.3  8e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 
292 aa  79.3  8e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.21965e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 
292 aa  79.3  8e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 
292 aa  79.3  8e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 
292 aa  79.3  8e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 
292 aa  79.3  8e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3371  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.92 
 
 
301 aa  79.3  8e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 
292 aa  79.3  8e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.42983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  26.88 
 
 
292 aa  79  9e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  32.02 
 
 
295 aa  78.6  1e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4452  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.98 
 
 
312 aa  78.6  1e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5081  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.04 
 
 
301 aa  78.6  1e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>