More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7513 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7513  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  100 
 
 
326 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5157  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  68.63 
 
 
321 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414541  hitchhiker  0.0087046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.25 
 
 
330 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0755  dihydrodipicolinate synthetase  50.32 
 
 
311 aa  288  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1084  dihydrodipicolinate synthetase  53.72 
 
 
301 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00262766  hitchhiker  0.00208818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4201  dihydrodipicolinate synthetase  50.48 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1030  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  50.97 
 
 
313 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113729  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4039  dihydrodipicolinate synthetase  47.88 
 
 
321 aa  268  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2020  dihydrodipicolinate synthetase  48.86 
 
 
301 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1718  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  48.71 
 
 
301 aa  264  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3337  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.56 
 
 
301 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3137  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  49.51 
 
 
300 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.321867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1689  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  44.41 
 
 
308 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448176  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1498  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  50.98 
 
 
291 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1875  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  43.42 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207996  normal  0.131652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.76 
 
 
307 aa  225  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  43.23 
 
 
313 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2587  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  43.28 
 
 
303 aa  222  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233222  hitchhiker  0.00609542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0788  dihydrodipicolinate synthetase  47.23 
 
 
306 aa  219  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.049848 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3393  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.86 
 
 
301 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3655  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.53 
 
 
301 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0251  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.58 
 
 
303 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05220  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  43.61 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5701  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.02 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0185  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  44.55 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1596  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.3 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1947  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  43.38 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357262  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05369  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  43.71 
 
 
311 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288036  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4586  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.11 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4452  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.11 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4549  dihydrodipicolinate synthetase family protein  40.85 
 
 
303 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4227  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.52 
 
 
303 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1793  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.6 
 
 
303 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3408  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.79 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.996701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0827  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.33 
 
 
303 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0328842  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1993  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.6 
 
 
303 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0280124  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5345  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  41.58 
 
 
301 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1729  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  41.78 
 
 
303 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00000952381  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3688  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.39 
 
 
304 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3371  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  41.88 
 
 
301 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2814  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.34 
 
 
303 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3599  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.8 
 
 
303 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815897  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3419  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.74 
 
 
328 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269003  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4736  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.39 
 
 
304 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3049  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.46 
 
 
304 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4951  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.46 
 
 
304 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551688  normal  0.0100534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.46 
 
 
304 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3098  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.8 
 
 
303 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1215  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.79 
 
 
303 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0332  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.46 
 
 
304 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.47 
 
 
303 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612252  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6531  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.13 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5081  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  41.88 
 
 
301 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4676  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.8 
 
 
304 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5204  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.8 
 
 
304 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484805  normal  0.145003 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1802  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.79 
 
 
305 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0287622  hitchhiker  0.00208874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5150  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  44.63 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4864  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.8 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556224  normal  0.0460344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1117  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  38.59 
 
 
303 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4103  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.8 
 
 
305 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0351  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.12 
 
 
304 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2499  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  44.44 
 
 
304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2392  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  42.76 
 
 
304 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.088042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0037  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  41.91 
 
 
304 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  33 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 
291 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.97 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 
291 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  29.77 
 
 
291 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
290 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  35.04 
 
 
308 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30.79 
 
 
297 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4436  dihydrodipicolinate synthetase  27.94 
 
 
311 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0722382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.75 
 
 
313 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  38.25 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  37.16 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  37.13 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  31.84 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 
298 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  32.45 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  31.87 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  34.9 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  28.05 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.36 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  29.13 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  26.77 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.85 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  32.57 
 
 
301 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 
293 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 
300 aa  93.2  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>