54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3089 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  47.45 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  48.17 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  49.72 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  50.84 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  46.04 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  45.74 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  44.5 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  45.03 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  42.35 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  43.43 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  45.4 
 
 		 300 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  43.46 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  42.42 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  43.46 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  43.48 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  44.64 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  43.43 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  42.16 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  39.13 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  40.33 
 
 		 283 aa  141  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  41.15 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  42.27 
 
 		 195 aa  141  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  42.68 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  37.89 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  42.33 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  35.98 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  40.24 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  40.57 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  41.73 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  34.08 
 
 		 182 aa  92  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  41.79 
 
 		 176 aa  89.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  29.12 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  34.59 
 
 		 198 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  28.81 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  32.41 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  33.94 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  31.45 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  32.08 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  30.71 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  28.99 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  32.5 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.98 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  26.49 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  31.65 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  26.32 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  26.32 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  24.83 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  25.49 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  29.6 
 
 		 267 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  32.23 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>