58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0034 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0034  peptidase M20  100 
 
 		 530 aa  1069    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.917037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3500  peptidase M20  42.91 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4285  peptidase M20  41.36 
 
 		 605 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194958  normal  0.944988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2784  peptidase M20  33.21 
 
 		 555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2792  peptidase M20  33.51 
 
 		 558 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3377  peptidase M20  33.46 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106714  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0950  arginine utilization protein RocB  41.56 
 
 		 536 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2610  peptidase M20  41.18 
 
 		 536 aa  264  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2323  peptidase M20  30.47 
 
 		 546 aa  256  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000106298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3028  peptidase M20  31.7 
 
 		 546 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.526527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3032  RocB protein  31.02 
 
 		 546 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00171175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2733  M20 family peptidase  31.02 
 
 		 546 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2249  RocB protein  30.43 
 
 		 546 aa  246  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00011132  hitchhiker  0.000447165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2784  RocB protein  31.02 
 
 		 546 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2996  RocB protein  31.02 
 
 		 546 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2714  M20 family peptidase  31.07 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.511155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2994  RocB protein  31.43 
 
 		 546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000537344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2996  RocB protein  30.66 
 
 		 546 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00165628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1394  peptidase M20  31.86 
 
 		 533 aa  243  7e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3030  RocB protein  30.66 
 
 		 546 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0929  peptidase M20  34.96 
 
 		 543 aa  196  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  30.68 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.72 
 
 		 377 aa  55.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 		 395 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.11 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.75 
 
 		 382 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.75 
 
 		 382 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.64 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  26.86 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.26 
 
 		 417 aa  47.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 		 376 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.73 
 
 		 426 aa  47  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.4 
 
 		 437 aa  47  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.32 
 
 		 447 aa  47  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.95 
 
 		 404 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.32 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.48 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.34 
 
 		 378 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.03 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.17 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.89 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  36.17 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2518  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.03 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00740773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3066  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.48 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  30.05 
 
 		 448 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  28.72 
 
 		 380 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49380  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.3 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.545113  normal  0.68412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  29.86 
 
 		 434 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  28 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  28.47 
 
 		 403 aa  44.3  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0277  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.14 
 
 		 401 aa  43.9  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1331  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.86 
 
 		 383 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0263045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1523  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.7 
 
 		 383 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.2 
 
 		 389 aa  43.5  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.69 
 
 		 381 aa  43.5  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>