More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3721 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  100 
 
 		 553 aa  1107    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  65.85 
 
 		 530 aa  690    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  60.24 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.74 
 
 		 533 aa  588  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.95 
 
 		 533 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.77 
 
 		 533 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.58 
 
 		 533 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  53.12 
 
 		 527 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  53.23 
 
 		 520 aa  526  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  51.36 
 
 		 537 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  51.07 
 
 		 543 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  50.97 
 
 		 543 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  50.68 
 
 		 543 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  50 
 
 		 543 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  47.9 
 
 		 531 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  51 
 
 		 526 aa  448  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  64.63 
 
 		 377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.41 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.84 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.43 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.3 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.05 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.52 
 
 		 492 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.3 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  28.48 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.43 
 
 		 493 aa  153  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  26.74 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  27.41 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  26.96 
 
 		 541 aa  146  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  27.68 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.91 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.04 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  24.78 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  26.77 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  27.14 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  26.28 
 
 		 489 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.64 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.82 
 
 		 492 aa  143  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.82 
 
 		 492 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  27.27 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  27.27 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.42 
 
 		 518 aa  143  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.39 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.77 
 
 		 485 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.62 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.62 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.62 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.66 
 
 		 496 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.93 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.2 
 
 		 492 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  25.65 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.37 
 
 		 483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  25.94 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.57 
 
 		 492 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  26.3 
 
 		 512 aa  137  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  27.59 
 
 		 496 aa  136  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.93 
 
 		 492 aa  136  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  25.94 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.51 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.9 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.91 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.96 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.19 
 
 		 488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.22 
 
 		 497 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  24.68 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1291  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  25.65 
 
 		 499 aa  128  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  24.2 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.8 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.77 
 
 		 513 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  24.14 
 
 		 497 aa  127  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  24.84 
 
 		 493 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  25.22 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  27.85 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  27.03 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  25.8 
 
 		 483 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  24.48 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  25.7 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  27.79 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  27.01 
 
 		 544 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  23.12 
 
 		 528 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  25.16 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  26.48 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  26.48 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  26.48 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  26.48 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  26.48 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  26.48 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  25.59 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  26.48 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  23.88 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.42 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>