49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2861 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1048    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  39.87 
 
 
302 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  36.61 
 
 
293 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  55.49 
 
 
534 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  54.19 
 
 
537 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  38.12 
 
 
413 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1159  hypothetical protein  29.56 
 
 
392 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  29.01 
 
 
684 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  30.74 
 
 
689 aa  140  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  33.7 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  35.35 
 
 
661 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  32.37 
 
 
361 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  34.73 
 
 
383 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  32.47 
 
 
502 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2010  hypothetical protein  30.41 
 
 
528 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  29.74 
 
 
521 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.1 
 
 
943 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
1313 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  35.94 
 
 
496 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  24.44 
 
 
823 aa  59.3  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  21.19 
 
 
514 aa  53.9  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  25.29 
 
 
477 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  27.01 
 
 
699 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.86 
 
 
1238 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  23.81 
 
 
476 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  23.4 
 
 
482 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
1285 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  22.47 
 
 
519 aa  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  32.09 
 
 
1689 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  22.47 
 
 
613 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5261  hypothetical protein  31.54 
 
 
690 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165104  hitchhiker  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  23.08 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  20.47 
 
 
835 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  33.91 
 
 
848 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
1063 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
1101 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 
1104 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
1958 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  25.35 
 
 
409 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  23.21 
 
 
481 aa  47.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  25.13 
 
 
467 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  29.48 
 
 
1914 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  29.03 
 
 
697 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  24.48 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  28.07 
 
 
1611 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  23.16 
 
 
806 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  26.44 
 
 
452 aa  43.5  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2815  hypothetical protein  24.11 
 
 
392 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>