More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2484 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  35.83 
 
 
244 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  35.74 
 
 
243 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  32.91 
 
 
246 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  32.91 
 
 
246 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  32.89 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  35.56 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  34.4 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.05 
 
 
243 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  34.76 
 
 
234 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  31.49 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  31.49 
 
 
235 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  31.06 
 
 
235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  32.91 
 
 
238 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  32.63 
 
 
235 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  31.78 
 
 
235 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  31.78 
 
 
235 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  35.96 
 
 
223 aa  132  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  35.29 
 
 
270 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  31.78 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  32.2 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  31.78 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  35.34 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  32.3 
 
 
235 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  30.13 
 
 
242 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  33.47 
 
 
254 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  31.65 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  32.89 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  31.58 
 
 
244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  35.09 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  31.9 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  28.33 
 
 
257 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  30.77 
 
 
238 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  34.21 
 
 
224 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  33.77 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.33 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  33.96 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  35.71 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  37.27 
 
 
222 aa  118  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  33.48 
 
 
226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  36.49 
 
 
222 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  32.08 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  30.64 
 
 
481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  37.16 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  32.31 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  31.8 
 
 
242 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  30.7 
 
 
233 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  31.47 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  32.19 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  30.54 
 
 
300 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  28.57 
 
 
241 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  27.16 
 
 
235 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  29.69 
 
 
245 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  30.54 
 
 
300 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  31.17 
 
 
242 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30.9 
 
 
292 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30.9 
 
 
292 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  30.38 
 
 
292 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  29.61 
 
 
295 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30.9 
 
 
292 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  30.9 
 
 
292 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  30.9 
 
 
292 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  30.9 
 
 
292 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  32.35 
 
 
247 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  29.05 
 
 
251 aa  105  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  26.81 
 
 
239 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  32.13 
 
 
226 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 
292 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 
292 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.19 
 
 
218 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  27.35 
 
 
252 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  29.66 
 
 
292 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  27.8 
 
 
321 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  27.5 
 
 
240 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  30.57 
 
 
223 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  27.24 
 
 
288 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  26.84 
 
 
231 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.79 
 
 
239 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.25 
 
 
262 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  27.95 
 
 
236 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  29 
 
 
285 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  29 
 
 
303 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  28.57 
 
 
316 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  25.88 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  31.91 
 
 
233 aa  99  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  28.09 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  31.8 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  26.03 
 
 
286 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  30.92 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  25.31 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  27.65 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  31.39 
 
 
219 aa  95.9  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  27.97 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  26.69 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>