More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0970 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  100 
 
 		 314 aa  627  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  54.73 
 
 		 298 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  29.19 
 
 		 304 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  36.36 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  36.96 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  31.48 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  39.46 
 
 		 299 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  34.92 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  34.93 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  35.53 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  35.37 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  35.62 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  34.56 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  34.45 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  34.45 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  34.45 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  34.45 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  34.45 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.56 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  35.56 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  34.47 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  34.47 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  31.54 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  34.56 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  34.47 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  34.47 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  34.11 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  32.55 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  29.87 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  33.11 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  32.35 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  32.89 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  34 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  33.56 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  32.89 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  33.56 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  31.1 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  31.31 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  29.53 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  31.35 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  29.14 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  34.12 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  32.49 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.66 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  31.23 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  33.45 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  29.25 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  34.58 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  31.63 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.67 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  33.22 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  26.97 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  30.85 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  31.41 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  34.56 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  32.15 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  29.02 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  31.67 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  31.76 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  35.41 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  32.14 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  29.29 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  26.32 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  32.13 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  26.17 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  33 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.87 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  36.08 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  26.6 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  32.43 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  25.95 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  27.61 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  29.01 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  26.01 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  31.19 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  29.01 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  29.01 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  26.71 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  25.96 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  29.55 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  29.01 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  30.89 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  28.67 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  25.25 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  30.1 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  32.04 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  28.67 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  28.67 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  34.13 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  30.87 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  26.26 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  28.67 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  31.1 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  33.79 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>