147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0830 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  33.05 
 
 
253 aa  130  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  33.05 
 
 
253 aa  130  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  31.51 
 
 
246 aa  130  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  32.74 
 
 
233 aa  120  1e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  32.74 
 
 
233 aa  120  1e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  32.74 
 
 
233 aa  120  1e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  34.42 
 
 
225 aa  117  1e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  32.46 
 
 
235 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  31.74 
 
 
247 aa  111  7e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  34.6 
 
 
226 aa  110  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  33.33 
 
 
229 aa  111  1e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  31.74 
 
 
238 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  31.72 
 
 
240 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  33.33 
 
 
221 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  33.33 
 
 
239 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  32.86 
 
 
221 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  33.65 
 
 
221 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  32.86 
 
 
215 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  32.9 
 
 
250 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  32.77 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  32.77 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  32.77 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  32.77 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  32.49 
 
 
246 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  32.84 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  40.91 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  33.33 
 
 
233 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  32.86 
 
 
227 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  40.31 
 
 
229 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  35.62 
 
 
201 aa  73.2  3e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  35.62 
 
 
201 aa  73.2  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.17 
 
 
165 aa  58.5  7e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.17 
 
 
165 aa  58.5  7e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46725e-13 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  30.66 
 
 
167 aa  58.5  8e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.13 
 
 
165 aa  55.8  5e-07  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.12 
 
 
139 aa  54.3  1e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30 
 
 
164 aa  53.9  2e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  24.83 
 
 
301 aa  53.1  3e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  26.43 
 
 
152 aa  52  6e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.34163e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  29.45 
 
 
154 aa  51.6  9e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  38.38 
 
 
137 aa  51.2  1e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  28.33 
 
 
164 aa  50.4  2e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23984e-08 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  31.82 
 
 
140 aa  50.1  3e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.77 
 
 
165 aa  50.1  3e-05  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  32.17 
 
 
568 aa  49.7  4e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  24.06 
 
 
302 aa  49.3  4e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  27.93 
 
 
154 aa  49.3  5e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  31.97 
 
 
165 aa  49.3  5e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  24.06 
 
 
302 aa  48.9  5e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  24.06 
 
 
302 aa  48.9  5e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  23.31 
 
 
478 aa  49.3  5e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  24.06 
 
 
302 aa  48.9  5e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  24.06 
 
 
302 aa  49.3  5e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  24.06 
 
 
302 aa  48.9  6e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1585  chemotaxis protein, CheW2  34.09 
 
 
163 aa  48.9  6e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  24.06 
 
 
302 aa  48.9  6e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0237  putative CheW protein  34.09 
 
 
163 aa  48.9  6e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  26.58 
 
 
164 aa  48.9  7e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.45541e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  29.85 
 
 
152 aa  48.5  8e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  31.18 
 
 
159 aa  48.5  8e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  29.85 
 
 
152 aa  48.5  8e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  24.06 
 
 
302 aa  48.5  8e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  27.34 
 
 
154 aa  48.1  9e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  26.52 
 
 
155 aa  48.1  9e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  23.31 
 
 
302 aa  48.1  9e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.15462e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  27.74 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  32.18 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  26.62 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  27.59 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  22.67 
 
 
163 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  27.74 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  33.98 
 
 
155 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  27.46 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  25.97 
 
 
184 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  30.51 
 
 
164 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  23.33 
 
 
165 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  26.53 
 
 
184 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.58 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  34.91 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  36.36 
 
 
163 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  31.48 
 
 
479 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  21.68 
 
 
162 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  27.46 
 
 
298 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  24 
 
 
331 aa  45.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1571  CheW-like domain-containing protein  23.53 
 
 
142 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.603726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  32.43 
 
 
163 aa  45.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  41.27 
 
 
137 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  25.97 
 
 
184 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  41.27 
 
 
137 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  29.71 
 
 
168 aa  45.1  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  25.97 
 
 
184 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  34.18 
 
 
178 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  34.18 
 
 
178 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  31.13 
 
 
531 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  41.27 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  25.74 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  25.42 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  25.42 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  26.81 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>