More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf422 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
145 aa  288  1e-77  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  57.04 
 
 
146 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 
146 aa  140  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  140  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  52.41 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  56.34 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 
145 aa  135  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  51.03 
 
 
149 aa  130  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 
146 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 
146 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 
162 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
147 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  48.59 
 
 
153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  47.89 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  47.92 
 
 
152 aa  124  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  48.23 
 
 
144 aa  124  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  47.89 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  47.22 
 
 
243 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  47.26 
 
 
154 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  45.83 
 
 
151 aa  122  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  50 
 
 
148 aa  123  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 
146 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
149 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  48.94 
 
 
144 aa  121  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  57.85 
 
 
147 aa  121  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 
157 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  46.85 
 
 
149 aa  120  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 
147 aa  120  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 
153 aa  120  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  45.83 
 
 
149 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  51.02 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  47.18 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  46.85 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  46.1 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  42.57 
 
 
160 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  46.53 
 
 
163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 
147 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
147 aa  117  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  46.48 
 
 
210 aa  116  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  43.84 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  46.62 
 
 
153 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  43.45 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  45.77 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  51.75 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  42.57 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  45.77 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  45.77 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  49.66 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  49.66 
 
 
147 aa  114  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  43.42 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  43.42 
 
 
160 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  43.54 
 
 
146 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  42.66 
 
 
148 aa  114  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  43.45 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 
156 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 
156 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  40.69 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  44.68 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  42.18 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 
171 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  41.89 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 
160 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  44.68 
 
 
164 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>