183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5937 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 254 aa  497  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  57.09 
 
 		 254 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  57.72 
 
 		 267 aa  289  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  55.12 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  56.85 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  61.48 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  58.61 
 
 		 250 aa  281  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  56.97 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  56.97 
 
 		 251 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  55.33 
 
 		 250 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  58.61 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  56.56 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.02 
 
 		 251 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  56.4 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  58.2 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  57.38 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  57.38 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  53.54 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  56.79 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  56.63 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  56.22 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  57.79 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  54.07 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  54.51 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  53.2 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  52.05 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  52.05 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  55.78 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  55.78 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  55.78 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.17 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.78 
 
 		 258 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  46.4 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.62 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.2 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  52.96 
 
 		 402 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  56.96 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  50.41 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  50.61 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  45.08 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  44.13 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  47.54 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  51.05 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.86 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.39 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  46.34 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  43.27 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  46.53 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  42.21 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  45.71 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  41.94 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  40.57 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  52.99 
 
 		 137 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  38.93 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.43 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  38.55 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  38.46 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  36.89 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.93 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  34.26 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.48 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.46 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.33 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  34.65 
 
 		 269 aa  85.1  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  35.16 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  32.9 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  32.56 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  34.5 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  36.84 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.64 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  29.89 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  32.44 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  30.36 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  30.22 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  32.58 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  30.73 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  30 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  30.41 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  29.31 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.84 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  32.42 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3136  NmrA family protein  37.72 
 
 		 337 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  30.83 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>