More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0301 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 457 aa  939    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  67.32 
 
 		 470 aa  646    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  75.18 
 
 		 408 aa  622  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  63.89 
 
 		 458 aa  617  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  64.11 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  64.11 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  64.11 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  64.11 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  64.11 
 
 		 458 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  64.11 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  64.11 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  64.11 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  63.89 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  64.38 
 
 		 454 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  63.89 
 
 		 458 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  64.27 
 
 		 459 aa  611  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  64.9 
 
 		 457 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  63.68 
 
 		 453 aa  610  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  64.32 
 
 		 484 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  66.83 
 
 		 415 aa  568  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  59.21 
 
 		 454 aa  558  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  59.21 
 
 		 454 aa  558  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  58.33 
 
 		 457 aa  545  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  54.27 
 
 		 457 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  54.85 
 
 		 449 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  52 
 
 		 460 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  52.3 
 
 		 453 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  52.28 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  53.51 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  52.84 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  51.88 
 
 		 455 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  52.94 
 
 		 454 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  52.79 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  54.87 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  52.64 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  52.65 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  51.11 
 
 		 450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 453 aa  468  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  52 
 
 		 449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  50.76 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  53.22 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 452 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 507 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  47.78 
 
 		 514 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  48.91 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  47.78 
 
 		 514 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  49.23 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  48.53 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  44.96 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 		 494 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  49.02 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  49.35 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  45.4 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 453 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  46.39 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  48.46 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  45.66 
 
 		 517 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 		 445 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  46.92 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 		 462 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  45.12 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  48.13 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  48.84 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 457 aa  418  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1280  DNA repair protein RadA  48.46 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  48.84 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  47.72 
 
 		 466 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  47.03 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 		 467 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  48.89 
 
 		 455 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3182  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.540345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  45.02 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  45.83 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  47.47 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  47.24 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>