More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0295 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1928  putative ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.495016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  49 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  49.79 
 
 		 245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.68 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.68 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  50.62 
 
 		 244 aa  238  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.68 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.68 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  238  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.68 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.26 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 244 aa  234  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 244 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.85 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  47.39 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.68 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.68 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.68 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.68 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  48.76 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  51.23 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  51.23 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  49 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  46 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.26 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  48.16 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  48.56 
 
 		 245 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  48.8 
 
 		 275 aa  228  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.16 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  49.38 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  50.66 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  48.75 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.16 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  47.98 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  47.6 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.02 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  50.63 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  49.39 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  46.18 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  49.59 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 254 aa  224  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 		 244 aa  225  7e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  48.13 
 
 		 243 aa  224  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0779  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.02 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0798  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  48.77 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  47.22 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  48.98 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  48.55 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  50.82 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  48.96 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  51.61 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  44.98 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.36 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  46.15 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  47.35 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  46.72 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  48.73 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  48.8 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.22 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  48.07 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  47.76 
 
 		 248 aa  222  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  49.79 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  48.55 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  44.31 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  47.92 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  43.32 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  49.79 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  47.76 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 		 598 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.79 
 
 		 595 aa  221  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  44.94 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  48.15 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.13 
 
 		 244 aa  221  8e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 246 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.18 
 
 		 592 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4165  ABC transporter related  44.72 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  48 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  48.19 
 
 		 263 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.38 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>