More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0058 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  455  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0710  DNA-binding response regulator  60.37 
 
 		 221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00420398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1328  DNA-binding response regulator  52.44 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00114355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  44.34 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23930  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.46 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00212671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  39.05 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 240 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.1 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.9 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2301  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.19 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  40.8 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.07 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  40.39 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  38.92 
 
 		 283 aa  151  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  38.31 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  42.08 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  39 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.92 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  38.42 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  40.95 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  38.92 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  38.42 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  38.57 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  40.1 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.31 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  38.91 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  41.58 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.35 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.35 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  39 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  37.81 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  38.32 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.9 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.86 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.81 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  38.42 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.86 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  37.91 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.84 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  38.28 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.81 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  37.31 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  37.68 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  36.95 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.81 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  39.71 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.31 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.31 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  36.89 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  38.35 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.09 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.8 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  38.35 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  38.35 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.8 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  36.95 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0453  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  36.89 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.73 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  38.83 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.8 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  37.38 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 224 aa  141  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  37.2 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.95 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  37.2 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.35 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>