More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0403 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  100 
 
 
329 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  100 
 
 
329 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  39.74 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  42.09 
 
 
312 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  37.89 
 
 
314 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  36.62 
 
 
325 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  36.91 
 
 
313 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  35.53 
 
 
318 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  37.38 
 
 
306 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  33.65 
 
 
321 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  36.22 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  35.9 
 
 
316 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  35.26 
 
 
314 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.1 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  36.22 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  34.29 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  35.9 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  34.29 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  34.94 
 
 
314 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  35.58 
 
 
313 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  35.37 
 
 
315 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  35.24 
 
 
320 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  34.29 
 
 
314 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  34.6 
 
 
320 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  34.58 
 
 
317 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  33.44 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  36.56 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  34.94 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  31.85 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  30.23 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  31.66 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  44.96 
 
 
132 aa  116  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.22 
 
 
131 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.38 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 
147 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
137 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.38 
 
 
128 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.38 
 
 
128 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  34.38 
 
 
329 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.38 
 
 
128 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.03 
 
 
132 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  46.4 
 
 
142 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  48.36 
 
 
141 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  43.31 
 
 
132 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.06 
 
 
134 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
147 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
147 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
147 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  45.32 
 
 
150 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  42.52 
 
 
132 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  48 
 
 
142 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  44 
 
 
147 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  42.52 
 
 
132 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
147 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  47.57 
 
 
138 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  46.67 
 
 
334 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  41.09 
 
 
134 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  42.06 
 
 
130 aa  102  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 
148 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 
134 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 
148 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  41.27 
 
 
130 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  49.49 
 
 
153 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  46.67 
 
 
149 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
152 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  46.67 
 
 
149 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  46.67 
 
 
149 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  48.41 
 
 
129 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  40.48 
 
 
130 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  46.67 
 
 
149 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  46.67 
 
 
149 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  46.67 
 
 
149 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  40.48 
 
 
130 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
152 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  40.91 
 
 
315 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  45.83 
 
 
149 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 
149 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 
149 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 
169 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  47.22 
 
 
137 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
153 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  46.03 
 
 
130 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 
155 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  39.68 
 
 
130 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  44.17 
 
 
135 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  46.9 
 
 
138 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  39.06 
 
 
129 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  50.51 
 
 
151 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  48 
 
 
172 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  40.8 
 
 
129 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  42.52 
 
 
138 aa  96.7  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  46.73 
 
 
138 aa  96.3  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
133 aa  96.3  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  46.73 
 
 
138 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  40.32 
 
 
132 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
133 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  42.4 
 
 
134 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  46.73 
 
 
135 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  47.27 
 
 
138 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 
141 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>