More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3332 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.45 
 
 		 501 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2536  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  77.84 
 
 		 504 aa  783    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_003296  RS02392  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  73.15 
 
 		 499 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1113  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.85 
 
 		 496 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1035  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.32 
 
 		 506 aa  792    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3497  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67 
 
 		 500 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.412544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.73 
 
 		 496 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000962307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3524  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  81.82 
 
 		 506 aa  838    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132108  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2931  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.05 
 
 		 508 aa  698    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3917  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.56 
 
 		 512 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  78.51 
 
 		 511 aa  797    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228893  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.02 
 
 		 500 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1185  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.04 
 
 		 496 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  74.14 
 
 		 505 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4274  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.11 
 
 		 507 aa  734    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463031  normal  0.914985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  78.06 
 
 		 535 aa  805    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0202  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.05 
 
 		 508 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  61.51 
 
 		 496 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1611  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.05 
 
 		 508 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.34 
 
 		 508 aa  661    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4576  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  78.44 
 
 		 506 aa  791    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1883  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  77.25 
 
 		 506 aa  778    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0709118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2521  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.85 
 
 		 499 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2619  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  76.02 
 
 		 522 aa  746    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719043  normal  0.528801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3333  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.14 
 
 		 508 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1410  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  78.04 
 
 		 506 aa  808    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50080  malonate/methylmalonate semialdehyde dehydrogenase  67.75 
 
 		 499 aa  661    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2416  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.2 
 
 		 497 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4547  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  78.11 
 
 		 510 aa  764    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0015  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.15 
 
 		 512 aa  715    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4070  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.05 
 
 		 508 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3822  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  79.04 
 
 		 506 aa  820    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2023  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.66 
 
 		 507 aa  721    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794475  normal  0.0299094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.45 
 
 		 496 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.887195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4812  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  78.04 
 
 		 506 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1151  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.04 
 
 		 496 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3332  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 505 aa  1036    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.63 
 
 		 505 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3248  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.71 
 
 		 509 aa  634    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0950  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  77.64 
 
 		 506 aa  807    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2990  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.05 
 
 		 540 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5671  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.98 
 
 		 505 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.84 
 
 		 496 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00014498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0965  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.26 
 
 		 496 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0738299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3379  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.05 
 
 		 540 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  77.64 
 
 		 506 aa  806    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1138  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.59 
 
 		 499 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1083  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.24 
 
 		 496 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000148294  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  61.3 
 
 		 496 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  61.1 
 
 		 496 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3023  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.76 
 
 		 499 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0588426  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4384  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.11 
 
 		 507 aa  734    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.640119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  77.64 
 
 		 506 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5814  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.26 
 
 		 507 aa  727    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5681  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  81.04 
 
 		 503 aa  822    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  76.25 
 
 		 502 aa  755    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0980  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  75.8 
 
 		 512 aa  749    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  77.64 
 
 		 506 aa  807    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3996  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.05 
 
 		 508 aa  696    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2368  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.86 
 
 		 504 aa  633  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.78 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0935  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.64 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0357372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.91 
 
 		 499 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1043  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.84 
 
 		 496 aa  626  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205992  normal  0.342071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.71 
 
 		 499 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.75 
 
 		 509 aa  621  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3694  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.4 
 
 		 498 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.45 
 
 		 498 aa  616  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.39 
 
 		 497 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.04 
 
 		 497 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.63 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000457228  decreased coverage  0.0000167809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.43 
 
 		 497 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4746  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  59.84 
 
 		 505 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4566  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.43 
 
 		 497 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000243063  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3021  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.36 
 
 		 497 aa  610  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0637  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.43 
 
 		 497 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149078  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3456  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.24 
 
 		 505 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.19 
 
 		 497 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4044  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.75 
 
 		 498 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.31 
 
 		 506 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 		 497 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4104  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.04 
 
 		 505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.45 
 
 		 497 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00766  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.81 
 
 		 496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.98 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3662  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.22 
 
 		 496 aa  598  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3049  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.06 
 
 		 508 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1877  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.86 
 
 		 508 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2977  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.06 
 
 		 508 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0098  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.69 
 
 		 498 aa  594  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4293  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 505 aa  591  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74921  normal  0.50186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6743  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.97 
 
 		 498 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0372  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.18 
 
 		 501 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4060  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.22 
 
 		 496 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.06 
 
 		 498 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4438  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.72 
 
 		 518 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68099  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0414  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  58.38 
 
 		 498 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.04 
 
 		 505 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.174243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1542  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.24 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0780531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0729  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.04 
 
 		 501 aa  588  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0269799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>