More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2521 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0419  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.31 
 
 		 498 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214339  hitchhiker  0.00208567 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2990  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.76 
 
 		 540 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02392  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  68.56 
 
 		 499 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2521  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 499 aa  1016    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5814  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.88 
 
 		 507 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.31 
 
 		 498 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 		 498 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.85 
 
 		 500 aa  662    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4274  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.68 
 
 		 507 aa  670    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463031  normal  0.914985 
 
 
-
 
NC_004310  BR1832  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  63.91 
 
 		 498 aa  671    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.800551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.97 
 
 		 497 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1765  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  63.71 
 
 		 498 aa  671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3940  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.41 
 
 		 498 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.90589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3379  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.76 
 
 		 540 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3996  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.41 
 
 		 508 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.31 
 
 		 496 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00014498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3822  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.66 
 
 		 506 aa  663    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3524  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  68.89 
 
 		 506 aa  680    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132108  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2931  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.62 
 
 		 508 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0980  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66 
 
 		 512 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3021  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.23 
 
 		 497 aa  653    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13552  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.56 
 
 		 508 aa  830    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.37 
 
 		 497 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.47 
 
 		 502 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  86.77 
 
 		 499 aa  882    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0965  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.2 
 
 		 496 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0738299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2193  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.04 
 
 		 498 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.365355  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0324  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.83 
 
 		 498 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.948085  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3694  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.1 
 
 		 498 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  67.68 
 
 		 505 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  64.72 
 
 		 535 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0202  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.62 
 
 		 508 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2619  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.62 
 
 		 522 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719043  normal  0.528801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  85.77 
 
 		 499 aa  862    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1185  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 		 496 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1410  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.24 
 
 		 506 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4384  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.68 
 
 		 507 aa  670    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.640119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3248  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.23 
 
 		 509 aa  825    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.91 
 
 		 496 aa  675    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.887195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.85 
 
 		 506 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2071  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  64.43 
 
 		 501 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3332  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.85 
 
 		 505 aa  641    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.4 
 
 		 496 aa  691    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000962307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3333  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.73 
 
 		 508 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2368  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.45 
 
 		 504 aa  661    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2117  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.02 
 
 		 498 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3917  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.66 
 
 		 512 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1113  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.98 
 
 		 496 aa  667    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3095  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.69 
 
 		 498 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.769898  normal  0.126836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3003  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.6 
 
 		 503 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0015  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.05 
 
 		 512 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2399  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.92 
 
 		 502 aa  653    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169024  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.85 
 
 		 509 aa  708    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2023  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.47 
 
 		 507 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794475  normal  0.0299094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1035  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.08 
 
 		 506 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3302  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.02 
 
 		 537 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1446  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63 
 
 		 507 aa  670    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.1 
 
 		 498 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1083  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 		 496 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000148294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.07 
 
 		 505 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1043  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.66 
 
 		 496 aa  672    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205992  normal  0.342071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  85.97 
 
 		 499 aa  865    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0950  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.84 
 
 		 506 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.43 
 
 		 496 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0935  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.4 
 
 		 501 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3578  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  61.69 
 
 		 498 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.605326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10767  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase mmsA  61.1 
 
 		 510 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0017569  normal  0.759995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1334  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.4 
 
 		 503 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2416  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.74 
 
 		 497 aa  710    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.32 
 
 		 506 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.71 
 
 		 498 aa  674    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4812  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.31 
 
 		 506 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4070  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.62 
 
 		 508 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.84 
 
 		 496 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1068  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.91 
 
 		 498 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.43 
 
 		 496 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.67 
 
 		 506 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3023  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.53 
 
 		 499 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0588426  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1151  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 		 496 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.24 
 
 		 506 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2475  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 		 498 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1138  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  86.37 
 
 		 499 aa  863    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1611  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.62 
 
 		 508 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  61.21 
 
 		 497 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5681  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.72 
 
 		 503 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6743  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.53 
 
 		 498 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0420  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.1 
 
 		 499 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 		 497 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.84 
 
 		 506 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.87 
 
 		 511 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228893  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2536  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  64.85 
 
 		 504 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1362  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.47 
 
 		 534 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.56 
 
 		 497 aa  633  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4746  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.44 
 
 		 505 aa  631  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4576  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.64 
 
 		 506 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3343  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63 
 
 		 503 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0618  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.72 
 
 		 499 aa  631  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.16 
 
 		 497 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000457228  decreased coverage  0.0000167809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50080  malonate/methylmalonate semialdehyde dehydrogenase  65.52 
 
 		 499 aa  628  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0372  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.34 
 
 		 501 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>