More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4249 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_4070  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 508 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2536  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  66.87 
 
 		 504 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_003296  RS02392  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  69.64 
 
 		 499 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1035  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.74 
 
 		 506 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.57 
 
 		 496 aa  639    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.887195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1410  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.8 
 
 		 506 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3497  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.93 
 
 		 500 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.412544  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3917  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 512 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5814  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.73 
 
 		 507 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.42 
 
 		 496 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000962307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3822  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  64.06 
 
 		 506 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2931  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 508 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3332  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.45 
 
 		 505 aa  668    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1185  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 		 496 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.27 
 
 		 500 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.31 
 
 		 502 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5671  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.03 
 
 		 505 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.04 
 
 		 499 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  68.67 
 
 		 505 aa  685    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1083  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.46 
 
 		 496 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000148294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.85 
 
 		 535 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0202  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 508 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1151  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.77 
 
 		 496 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4576  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.79 
 
 		 506 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2990  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 540 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2521  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.91 
 
 		 499 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2368  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.98 
 
 		 504 aa  645    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 501 aa  1016    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3524  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  66.87 
 
 		 506 aa  673    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132108  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3333  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 508 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4384  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.68 
 
 		 507 aa  683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.640119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0015  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 		 512 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1611  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 508 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.38 
 
 		 511 aa  659    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228893  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2023  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.33 
 
 		 507 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794475  normal  0.0299094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2416  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 		 497 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.88 
 
 		 505 aa  682    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1883  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67 
 
 		 506 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0709118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0950  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 506 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4812  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.86 
 
 		 506 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.1 
 
 		 499 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1113  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60 
 
 		 496 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3379  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 540 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25753  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4274  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.68 
 
 		 507 aa  683    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463031  normal  0.914985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.57 
 
 		 496 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00014498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3023  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.2 
 
 		 499 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0588426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.4 
 
 		 506 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3996  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 508 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  60.81 
 
 		 497 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5681  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.39 
 
 		 503 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50080  malonate/methylmalonate semialdehyde dehydrogenase  64.93 
 
 		 499 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 506 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67 
 
 		 506 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0980  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.56 
 
 		 512 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.84 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4547  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.85 
 
 		 510 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1138  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.91 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1043  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.61 
 
 		 496 aa  633  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205992  normal  0.342071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0965  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.81 
 
 		 496 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0738299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.85 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.16 
 
 		 497 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0637  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.16 
 
 		 497 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149078  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0935  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.8 
 
 		 501 aa  628  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0357372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4566  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.16 
 
 		 497 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000243063  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2619  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.92 
 
 		 522 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719043  normal  0.528801 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.65 
 
 		 496 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.45 
 
 		 496 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.81 
 
 		 497 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.36 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.05 
 
 		 509 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000457228  decreased coverage  0.0000167809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.88 
 
 		 508 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.16 
 
 		 497 aa  624  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3694  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  59.32 
 
 		 498 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3248  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 509 aa  618  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.75 
 
 		 497 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2977  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.8 
 
 		 508 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3049  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.6 
 
 		 508 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1877  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.8 
 
 		 508 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.37 
 
 		 506 aa  611  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.75 
 
 		 498 aa  604  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0098  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.92 
 
 		 498 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2399  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.1 
 
 		 502 aa  598  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169024  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4060  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.43 
 
 		 496 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3662  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.63 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.66 
 
 		 498 aa  598  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3343  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.96 
 
 		 503 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0729  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.24 
 
 		 501 aa  594  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0269799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00766  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.34 
 
 		 496 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6743  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.13 
 
 		 498 aa  592  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.85 
 
 		 498 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0741  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.44 
 
 		 506 aa  591  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2245  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.62 
 
 		 500 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2475  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.25 
 
 		 498 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3003  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.37 
 
 		 503 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56.65 
 
 		 498 aa  588  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4746  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.86 
 
 		 505 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0823  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60 
 
 		 503 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4044  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.73 
 
 		 498 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3302  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.45 
 
 		 537 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>