165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0069 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  100 
 
 		 603 aa  1243    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  32.91 
 
 		 877 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  30.11 
 
 		 760 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  31.48 
 
 		 679 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  28.09 
 
 		 895 aa  187  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2001  multicopper oxidase, type 2  28.38 
 
 		 936 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  28.48 
 
 		 1131 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  28.31 
 
 		 1131 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1131 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  31.97 
 
 		 512 aa  170  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  30.38 
 
 		 536 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0649  multicopper oxidase type 2  25.73 
 
 		 945 aa  158  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  29.58 
 
 		 487 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  30.32 
 
 		 515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  31.36 
 
 		 536 aa  154  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  28.48 
 
 		 508 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 		 499 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29.89 
 
 		 486 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  29.84 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  27.39 
 
 		 547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.85 
 
 		 528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  27.7 
 
 		 516 aa  123  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  27.03 
 
 		 510 aa  120  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  29.37 
 
 		 569 aa  118  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  30.51 
 
 		 647 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  28.9 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  29.19 
 
 		 506 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  24.94 
 
 		 532 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  27.97 
 
 		 625 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  30.11 
 
 		 523 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  28.1 
 
 		 620 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  25.78 
 
 		 502 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  25.78 
 
 		 502 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  29.97 
 
 		 488 aa  107  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  24.22 
 
 		 499 aa  107  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  25.5 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  28.12 
 
 		 519 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  25.45 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.72 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  24.9 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.16 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  26.31 
 
 		 631 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  26.44 
 
 		 706 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  27.96 
 
 		 625 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  27.49 
 
 		 493 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  26.95 
 
 		 493 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  27.11 
 
 		 677 aa  98.6  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  24.89 
 
 		 538 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  26.29 
 
 		 535 aa  97.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  26.22 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  26.22 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  24.03 
 
 		 551 aa  94.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  25.42 
 
 		 524 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  23.95 
 
 		 471 aa  92.8  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  26.91 
 
 		 643 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  26.01 
 
 		 535 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  32.17 
 
 		 708 aa  91.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  24.95 
 
 		 519 aa  91.3  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  25.94 
 
 		 531 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  25.78 
 
 		 533 aa  90.9  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  23.37 
 
 		 492 aa  90.1  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  25.11 
 
 		 536 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  25.11 
 
 		 536 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.53 
 
 		 586 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  25.71 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.11 
 
 		 536 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.11 
 
 		 536 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.11 
 
 		 536 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  23.2 
 
 		 471 aa  87.8  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  23.4 
 
 		 515 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  22.83 
 
 		 470 aa  87.4  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  26.88 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  26.88 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  26.88 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  26.88 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  26.88 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  26.84 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  26.88 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  26.88 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  26.88 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.11 
 
 		 591 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  23.77 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  27.64 
 
 		 779 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  25.64 
 
 		 534 aa  85.1  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  32.26 
 
 		 628 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  22.22 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  23.42 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.62 
 
 		 579 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  21.56 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  26.55 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  26.55 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  26.55 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  30.98 
 
 		 645 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  25.58 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  25.24 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0500  cell division protein SufI  27.11 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  26.74 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  23.1 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  25.32 
 
 		 476 aa  83.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>