187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1667 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  57.77 
 
 		 297 aa  366  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  52.13 
 
 		 304 aa  315  5e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  36.24 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  35.71 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  38.14 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  35.29 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.67 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  33.77 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  36.25 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  36.25 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  32.89 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.89 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.89 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  32.89 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.36 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.44 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  34.63 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.44 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.44 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.57 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.44 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.44 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  32.32 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  28.52 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  30.43 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  27.88 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  31.93 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  30.72 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  28.2 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  27.87 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  28.2 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  28.2 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  28.52 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  36.57 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  36.25 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  36.25 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  36.25 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  35.92 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  27.87 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  36.25 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  31.69 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.86 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.54 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  33.66 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  31.58 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  31.58 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  29.32 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 530 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  31.93 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  28.27 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  25.62 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  25.62 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.17 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  27.11 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  24.38 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.92 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  27.64 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  27.8 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24.62 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  23.94 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  25.08 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  26.87 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  24.83 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.7 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  24.32 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  26.67 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  29.13 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  23.89 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  27.91 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  24.45 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  24.75 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  23.85 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  23.85 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.06 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  26.5 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  22.53 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  24.6 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.37 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.85 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  23.78 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>