More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0778 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0728  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  55.27 
 
 
591 aa  669    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.414053 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0778  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 
605 aa  1240    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000335108  hitchhiker  0.00000000000176984 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  71.43 
 
 
590 aa  862    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  0.000000000000014746 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1666  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  65.25 
 
 
467 aa  633  1e-180  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1615  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  47.24 
 
 
596 aa  499  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176956  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D17  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  42.11 
 
 
600 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2026  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  42.91 
 
 
600 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00409621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  39.9 
 
 
593 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  37.44 
 
 
591 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  37.44 
 
 
593 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.63 
 
 
593 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.64 
 
 
593 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  35.64 
 
 
593 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.91 
 
 
592 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.26 
 
 
593 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  35.64 
 
 
593 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 
591 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1115  extracellular solute-binding protein family 5  35.23 
 
 
596 aa  324  3e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  33.1 
 
 
592 aa  316  7e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  22.38 
 
 
557 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.74 
 
 
580 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  21.98 
 
 
574 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.5 
 
 
579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  22.38 
 
 
573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  21.67 
 
 
572 aa  144  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 
579 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 
617 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
639 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 
575 aa  108  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
522 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.94 
 
 
538 aa  104  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.26 
 
 
575 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 
559 aa  104  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.89 
 
 
567 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 
607 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 
607 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.72 
 
 
566 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.95 
 
 
546 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.3 
 
 
575 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
567 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  22.33 
 
 
575 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  20.24 
 
 
565 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 
538 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 
575 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 
539 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 
540 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 
551 aa  95.9  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.76 
 
 
528 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.76 
 
 
528 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.92 
 
 
555 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 
600 aa  94.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  23.54 
 
 
575 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.43 
 
 
559 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  24.05 
 
 
575 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 
575 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.01 
 
 
529 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.88 
 
 
529 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.58 
 
 
528 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  21.73 
 
 
576 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.58 
 
 
528 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.07 
 
 
575 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.58 
 
 
528 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.4 
 
 
528 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  22.78 
 
 
532 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
579 aa  90.5  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 
529 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
531 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  25.66 
 
 
531 aa  90.1  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 
541 aa  88.2  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
529 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  22.43 
 
 
538 aa  87  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  21.97 
 
 
534 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.06 
 
 
605 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
581 aa  86.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.89 
 
 
511 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.85 
 
 
521 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.85 
 
 
521 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.85 
 
 
521 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
521 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.85 
 
 
521 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 
534 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.24 
 
 
529 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
522 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  20.93 
 
 
590 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 
529 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 
591 aa  84  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.76 
 
 
542 aa  83.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  19.75 
 
 
524 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 
544 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 
517 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  22.9 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
547 aa  81.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 
593 aa  81.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3427  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 
544 aa  80.9  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.39 
 
 
550 aa  80.5  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  23.92 
 
 
537 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>