More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11750 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  100 
 
 
495 aa  975    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  55.29 
 
 
434 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  48.34 
 
 
461 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  51.43 
 
 
430 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  54.22 
 
 
442 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  50.33 
 
 
452 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  51.31 
 
 
425 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  47.44 
 
 
483 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  49.39 
 
 
438 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  52.39 
 
 
484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  51.72 
 
 
464 aa  350  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  50.13 
 
 
457 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  49.25 
 
 
454 aa  348  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  47.93 
 
 
435 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  48.51 
 
 
464 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  45.32 
 
 
490 aa  334  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  47.49 
 
 
426 aa  332  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  45 
 
 
447 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  45.89 
 
 
443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  44.69 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  44.69 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  44.69 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  43.86 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  45.48 
 
 
437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  45.97 
 
 
432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  45.72 
 
 
432 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  43.03 
 
 
439 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  41.85 
 
 
456 aa  303  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  46.21 
 
 
537 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 
448 aa  289  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  42 
 
 
465 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  45.7 
 
 
476 aa  248  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
441 aa  228  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 
444 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  34.7 
 
 
477 aa  219  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  35.85 
 
 
499 aa  216  8e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  33.65 
 
 
434 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  35.71 
 
 
420 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  30.43 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  35.95 
 
 
441 aa  192  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  36.56 
 
 
443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  32.66 
 
 
425 aa  190  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.26 
 
 
422 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.23 
 
 
421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  30.1 
 
 
420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.07 
 
 
417 aa  177  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  27.33 
 
 
455 aa  176  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  29.44 
 
 
419 aa  176  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.11 
 
 
430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  29.49 
 
 
487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  27.56 
 
 
455 aa  173  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  33.97 
 
 
426 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  31.97 
 
 
446 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.35 
 
 
425 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  35.01 
 
 
447 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  36.86 
 
 
439 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  30.18 
 
 
423 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.1 
 
 
421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 
444 aa  166  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  39.08 
 
 
284 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  30.48 
 
 
442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  30.62 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  32.33 
 
 
555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  34.63 
 
 
447 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  26.9 
 
 
429 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  28.03 
 
 
434 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  37.17 
 
 
285 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  27.21 
 
 
434 aa  163  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  29.63 
 
 
421 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  29.88 
 
 
421 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.02 
 
 
429 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  32.12 
 
 
427 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  39.21 
 
 
296 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  30.84 
 
 
467 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  27.78 
 
 
429 aa  160  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  30.21 
 
 
443 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  27.36 
 
 
424 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.65 
 
 
464 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  25.78 
 
 
414 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
435 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  26.98 
 
 
442 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  37.42 
 
 
456 aa  157  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  37.55 
 
 
284 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  28.33 
 
 
468 aa  156  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  29.98 
 
 
477 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  36.51 
 
 
276 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  28.71 
 
 
445 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  28.95 
 
 
464 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  33.22 
 
 
432 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  27.03 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  31.46 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30 
 
 
420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  25.91 
 
 
424 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  29.18 
 
 
464 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  26.39 
 
 
424 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  28.83 
 
 
443 aa  154  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  32.37 
 
 
454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  30.25 
 
 
443 aa  153  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  36.9 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  31.82 
 
 
444 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>