283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0925 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0925  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
173 aa  340  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000199253  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0399  flavin reductase domain-containing protein  56.6 
 
 
166 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.312372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0279  flavin reductase domain-containing protein  57.14 
 
 
167 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932981  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  52.94 
 
 
162 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4843  flavin reductase domain-containing protein  51.5 
 
 
170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0240  flavin reductase domain-containing protein  57.79 
 
 
161 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695925  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0250  flavin reductase-like, FMN-binding protein  57.14 
 
 
161 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0260  flavin reductase domain-containing protein  57.14 
 
 
161 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  54.02 
 
 
790 aa  157  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  48.47 
 
 
172 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  51.95 
 
 
184 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2759  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.33 
 
 
193 aa  150  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3777  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.25 
 
 
165 aa  148  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11968  oxidoreductase  47.13 
 
 
171 aa  144  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0356349  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4310  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.66 
 
 
203 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1234  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.12 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363078  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19380  conserved protein of DIM6/NTAB family  47.48 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.711289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4201  flavin reductase domain-containing protein  47.83 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313285  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  44.44 
 
 
207 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.76 
 
 
162 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.95 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.39 
 
 
171 aa  94.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  31.52 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  31.61 
 
 
172 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
393 aa  91.3  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  34.57 
 
 
170 aa  90.9  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  32.73 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  40.65 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34 
 
 
191 aa  88.6  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  38.99 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 
327 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.74 
 
 
404 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.98 
 
 
162 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  33.75 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  31.52 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  29.27 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.38 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  29.27 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  34.38 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.47 
 
 
170 aa  84.3  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  36.3 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  35 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  35 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  33.12 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.38 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  30.3 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  35.21 
 
 
204 aa  80.9  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.28 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  29.56 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  29.11 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.85 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.82 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  28.85 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  35.56 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  35.56 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.07 
 
 
311 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.94 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  33.58 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  29.8 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.13 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  30.91 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  32.59 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0350  flavin reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  38.81 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  29.22 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  30.13 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  30.67 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.16 
 
 
316 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  33.58 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  34.07 
 
 
306 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  28.21 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.81 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  32.84 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  30 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.79 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.43 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  31.41 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  32.65 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  31.18 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  30.32 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>