More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2085 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  59.36 
 
 		 219 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  59.07 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  61.32 
 
 		 223 aa  245  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  55.36 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  47.71 
 
 		 220 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  47 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  48.1 
 
 		 224 aa  193  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  44.55 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.29 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  44.76 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  42.18 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  46.76 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  43.6 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  42.33 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  41.43 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.91 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  40.48 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  40.57 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.06 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.52 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  40.57 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  39.34 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  38.39 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  37.09 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  35.71 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  39.05 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  39.05 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  30.8 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  27.98 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.33 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  30.33 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.17 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  31.16 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 239 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  29.68 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  30.52 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  27.1 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.29 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 		 242 aa  98.6  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 		 234 aa  98.2  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  30.56 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  32.11 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.65 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  30.7 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  27.52 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  29.44 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  30.09 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  29.67 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>