More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0589 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 100 aa  200  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  79.38 
 
 		 100 aa  161  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  77.32 
 
 		 100 aa  159  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  73.96 
 
 		 103 aa  153  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  77.08 
 
 		 101 aa  153  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  70.83 
 
 		 107 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  76.09 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  69 
 
 		 100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  72.83 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  72.83 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  68.32 
 
 		 101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  69.89 
 
 		 101 aa  136  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  67.71 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  67.02 
 
 		 99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  62.24 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  67.37 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  67.37 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  67.37 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  65.93 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  66.32 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  69.23 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  65.62 
 
 		 99 aa  124  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  62.11 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  65.26 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  64.21 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  65.26 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  60 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  65.59 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  60 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  61.05 
 
 		 100 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  65.26 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  58.59 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  59.79 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  57.89 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  57.89 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  56.7 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  55.67 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  59.18 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  55.32 
 
 		 95 aa  95.9  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  51.06 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  55.68 
 
 		 96 aa  92.8  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  52.75 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  52.17 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  52.08 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  56.38 
 
 		 99 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  55.81 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  53.19 
 
 		 96 aa  87.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 93 aa  87  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  50.54 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  55.32 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  56.38 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  52.81 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  55.32 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  53.93 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  53.93 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  53.93 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  53.93 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  48.86 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  52.04 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  48.48 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  48.39 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  47.56 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  51.55 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>