More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2453 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 278 aa  557  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 		 272 aa  321  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.6 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.9 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.79 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  43.64 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  40.99 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  42.5 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 272 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 		 280 aa  191  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0560563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.24 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  38.69 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 		 277 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  41.55 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  40.23 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.26 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1005  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01319  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.91 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004148  putative oxidoreductase  36.88 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.97 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  33.57 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  37.79 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  33.57 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  37.79 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  33.57 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.83 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 275 aa  161  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0500  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.84 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 344 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  34.18 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.41 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.84 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 305 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 277 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0945  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  36.88 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  38.24 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.57 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  38.7 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  37.09 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 		 258 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 272 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>