More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0305 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
283 aa  551  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  63.29 
 
 
298 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  51.44 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  43.3 
 
 
208 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  36.71 
 
 
211 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  33.79 
 
 
295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  34.02 
 
 
295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  34.36 
 
 
295 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  37.69 
 
 
206 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  33.1 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  32.6 
 
 
292 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  32.6 
 
 
292 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  29.93 
 
 
291 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  42 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  42 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  33.95 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  31.82 
 
 
291 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  44.03 
 
 
291 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  30.52 
 
 
291 aa  116  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  38.07 
 
 
207 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  31.8 
 
 
288 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  40.67 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  28.99 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  30.6 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  40.67 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  40.67 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  30.66 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  44.03 
 
 
293 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  37.7 
 
 
208 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  32.52 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  32.27 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  30.8 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  37.88 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  37.7 
 
 
194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  30.9 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  39.33 
 
 
291 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  39.55 
 
 
214 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  41.33 
 
 
291 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  32.18 
 
 
293 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  33.48 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  30.31 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  31.23 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  31.11 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  32.62 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  36.96 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  37.71 
 
 
195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 
439 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  39.78 
 
 
181 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  37.04 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  37.04 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37.5 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  31.38 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  37.57 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  39.07 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 
285 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  39.74 
 
 
286 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  37.76 
 
 
208 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  39.74 
 
 
286 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  39.07 
 
 
285 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  42.54 
 
 
293 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  39.46 
 
 
197 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  39.66 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  32.38 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 
285 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 
285 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 
285 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  40.4 
 
 
286 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 
285 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 
285 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  28.71 
 
 
297 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  38.41 
 
 
285 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  32.65 
 
 
293 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  36.22 
 
 
239 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  36.6 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  36.93 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  42.96 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  39.07 
 
 
286 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  37.11 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  40.46 
 
 
285 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  30.3 
 
 
304 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  40.46 
 
 
285 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  38.42 
 
 
210 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  37.75 
 
 
285 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  37.75 
 
 
285 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.08 
 
 
198 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  37.75 
 
 
285 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  38.76 
 
 
229 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  30.63 
 
 
288 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  42.22 
 
 
295 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  43.51 
 
 
293 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 
209 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  37.02 
 
 
204 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  39.07 
 
 
286 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
294 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  32.84 
 
 
806 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  37.01 
 
 
290 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
288 aa  106  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  41.35 
 
 
294 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>