More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3322 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3322  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 471 aa  907    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00350215  normal  0.0147191 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.01 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  31.19 
 
 		 532 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.7 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  32.13 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  31.41 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  29.25 
 
 		 529 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 516 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  31.24 
 
 		 525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  31.24 
 
 		 525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  31.24 
 
 		 525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 		 523 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  31.49 
 
 		 527 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.52 
 
 		 520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  29.03 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  27.09 
 
 		 563 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  31.87 
 
 		 470 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.25 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.71 
 
 		 516 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.81 
 
 		 510 aa  126  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  28.47 
 
 		 521 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  29.05 
 
 		 465 aa  123  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  31.27 
 
 		 554 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 		 518 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  29.37 
 
 		 584 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.07 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  27.8 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.18 
 
 		 568 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  28.93 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  26.84 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  28.7 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  25.61 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.55 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  28.47 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  22.61 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.09 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  22.38 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  22.38 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  22.38 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  22.38 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  22.38 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  22.38 
 
 		 484 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.38 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.32 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  25.91 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.07 
 
 		 524 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  27.78 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.44 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  30.47 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.79 
 
 		 572 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  23.06 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.93 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.79 
 
 		 550 aa  100  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  27.51 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  33.73 
 
 		 572 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.33 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  34.33 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  25.45 
 
 		 502 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  30.94 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  27.94 
 
 		 452 aa  97.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.92 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.52 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  26.83 
 
 		 459 aa  97.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  30.53 
 
 		 583 aa  96.7  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  37.88 
 
 		 469 aa  96.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  29.49 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.29 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  28.08 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.98 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  25.96 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  25.96 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  28.24 
 
 		 554 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  26.83 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.56 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.96 
 
 		 470 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  27.19 
 
 		 538 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.96 
 
 		 470 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  35.47 
 
 		 465 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.03 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.46 
 
 		 464 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.86 
 
 		 470 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.53 
 
 		 493 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  30.94 
 
 		 460 aa  93.2  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.95 
 
 		 474 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.85 
 
 		 470 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.29 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.95 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  28.44 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  26.58 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.91 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.2 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  31.96 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  28.15 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.58 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.51 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  26.15 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  27.32 
 
 		 468 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  32.74 
 
 		 527 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.82 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  37.88 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>