180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2479 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 311 aa  608  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  40.72 
 
 		 341 aa  215  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  37.58 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  32.58 
 
 		 342 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  36.27 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  31.75 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  31.86 
 
 		 343 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  28.66 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  30.38 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  30.56 
 
 		 367 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  29.14 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  39.49 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  35.97 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  29.37 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  29.37 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  28.38 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.05 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  31.08 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.05 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  29.57 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  35.66 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  29.82 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.51 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.56 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  29.08 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  29.2 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  28.08 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  26.37 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  29.41 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  27.46 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  27.05 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  27.46 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  33.96 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  27.75 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  27.75 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  31.94 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  27.46 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  27.46 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  27.46 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  27.46 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  35 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  34.97 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  34.97 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  34.97 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  34.97 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  34.97 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  29.53 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  25.73 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  29.9 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  26.53 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  34.29 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  34.29 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  35.56 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  34.29 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  32.82 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  32.61 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  25.25 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  34 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.33 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  32 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  34.13 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  31.03 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  29.41 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  32.39 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  34.29 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  24.83 
 
 		 622 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  30.71 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  28.86 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  35.86 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  32.67 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  31.36 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  31.45 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  31.85 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  33.08 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  23.15 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  31.58 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  30.56 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  23.94 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  30.71 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  30.07 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  28.4 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  28.05 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  29.01 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.01 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.01 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  34.07 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  24.61 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  29.01 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  30.69 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  31.11 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  31.11 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  31.15 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  31.11 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  31.11 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  27.05 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  29.03 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>