129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0647 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  95.11 
 
 
348 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
704 aa  1426    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0837  N6 adenine-specific DNA methyltransferase  90.68 
 
 
354 aa  658    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.94 
 
 
284 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.41 
 
 
263 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.08 
 
 
291 aa  100  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  27.46 
 
 
271 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  31.19 
 
 
274 aa  98.6  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  33.33 
 
 
253 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.25 
 
 
284 aa  98.6  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  28.5 
 
 
253 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  28.5 
 
 
253 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.99 
 
 
254 aa  98.2  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  28.02 
 
 
253 aa  97.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.64 
 
 
251 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.35 
 
 
263 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  28.43 
 
 
263 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  32.73 
 
 
268 aa  90.9  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  32.27 
 
 
268 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  30.52 
 
 
268 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  31.16 
 
 
262 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  28.15 
 
 
259 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.5 
 
 
264 aa  89.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.17 
 
 
268 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.84 
 
 
321 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.1 
 
 
262 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.85 
 
 
265 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  32.21 
 
 
268 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  26.89 
 
 
262 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  26.89 
 
 
262 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  28.77 
 
 
263 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.1 
 
 
306 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  26.47 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.34 
 
 
306 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.51 
 
 
286 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.95 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.95 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.24 
 
 
296 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.24 
 
 
296 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  30.95 
 
 
251 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.39 
 
 
264 aa  79  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  26.4 
 
 
279 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  31.69 
 
 
296 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.04 
 
 
673 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  24.63 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  24.63 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  26.89 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.86 
 
 
283 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.66 
 
 
275 aa  76.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.82 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.25 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.33 
 
 
271 aa  72.4  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.91 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.84 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.54 
 
 
280 aa  70.1  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.57 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  27.03 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.34 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  26.34 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.78 
 
 
530 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.92 
 
 
301 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.83 
 
 
287 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  22.75 
 
 
279 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  29.55 
 
 
296 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.72 
 
 
274 aa  64.3  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  30 
 
 
163 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.28 
 
 
279 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  26.16 
 
 
280 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.35 
 
 
304 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  29.61 
 
 
285 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  24.32 
 
 
273 aa  61.6  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  23 
 
 
306 aa  62  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3085  Site-specific DNA methylase protein  33.12 
 
 
251 aa  61.6  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  23.43 
 
 
275 aa  60.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  24.35 
 
 
274 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.2 
 
 
294 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  21.71 
 
 
279 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.88 
 
 
310 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.32 
 
 
307 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  26.26 
 
 
283 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.28 
 
 
289 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  21.71 
 
 
279 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  25.31 
 
 
270 aa  55.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  24.86 
 
 
277 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.55 
 
 
273 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  23.84 
 
 
277 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  25.27 
 
 
280 aa  54.3  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  25.85 
 
 
309 aa  54.3  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  27.36 
 
 
638 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  28.81 
 
 
286 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  26.23 
 
 
294 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  24.21 
 
 
270 aa  53.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20420  DNA adenine methylase Dam  29.22 
 
 
305 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.180762 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  22.44 
 
 
289 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  23.68 
 
 
225 aa  52.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  26.55 
 
 
303 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  20.37 
 
 
305 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  26.09 
 
 
325 aa  51.6  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0651  hypothetical protein  30.09 
 
 
245 aa  50.8  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>