More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0542 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0542  putative cytochrome c  100 
 
 		 208 aa  433  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  39.78 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  40.45 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  41.13 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  35.75 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  34.86 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  35.27 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  34.94 
 
 		 271 aa  99  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.75 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  34.13 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  35.45 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  36.14 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  35.23 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  34.66 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  34.12 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  32.74 
 
 		 238 aa  89.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.61 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  29.33 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  29.76 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.16 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  31.53 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  31.52 
 
 		 281 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  32.94 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  30 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  36.22 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  30 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  30 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  30 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  30 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  31.61 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  29.95 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  29.95 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  32.74 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  29.44 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  32.74 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  32.75 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  32.35 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  34.55 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  32.75 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  35.33 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  31.64 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  29 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  30.5 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  30.37 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  31.78 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  30.99 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  29.82 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  33.14 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  30.89 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  28.57 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  29.82 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  31.49 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  27.88 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  31.55 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  31.55 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  27.88 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  31.55 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  31.55 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  31.55 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  27.88 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  27.88 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  31.55 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  29.67 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  27.88 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  27.88 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  27.88 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  29.15 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  30.35 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  28.17 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  29.88 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  30.41 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  30.43 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.95 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  29.88 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  29.29 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  28.02 
 
 		 284 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  31.55 
 
 		 545 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>