33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0057 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 		 176 aa  366  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  82.39 
 
 		 176 aa  312  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  81.25 
 
 		 176 aa  307  5.9999999999999995e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  75.57 
 
 		 176 aa  291  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  73.86 
 
 		 176 aa  284  5.999999999999999e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  51.72 
 
 		 173 aa  191  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  52.35 
 
 		 170 aa  186  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  53.89 
 
 		 170 aa  183  9e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  50 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  52.1 
 
 		 248 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  50.89 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  49.43 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  47.34 
 
 		 171 aa  170  7.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  48.21 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  43.1 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  43.68 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  43.1 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  43.68 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  41.38 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  44.97 
 
 		 182 aa  141  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 		 182 aa  134  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  43.2 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 		 178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  40.83 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  38.6 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  40.24 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  39.41 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  34.91 
 
 		 216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  36.65 
 
 		 217 aa  108  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  38.16 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  34.32 
 
 		 221 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.59 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  32.54 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>