240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2009 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 
191 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  57.89 
 
 
196 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  51.55 
 
 
202 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.46 
 
 
190 aa  168  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  48.66 
 
 
210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  47.92 
 
 
200 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  41.18 
 
 
194 aa  144  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  44.2 
 
 
194 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  44.26 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  38 
 
 
220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  36.63 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  38.76 
 
 
230 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  38.42 
 
 
207 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.19 
 
 
222 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.3 
 
 
224 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  42.19 
 
 
196 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  37.57 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  35.98 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  39.15 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.27 
 
 
211 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  39.78 
 
 
197 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.18 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.18 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  39.79 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  35.68 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.38 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  35.68 
 
 
210 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.18 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  35.18 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.18 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  35.86 
 
 
210 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  38.42 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  35.86 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  35.86 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  35.86 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  35.86 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  35.86 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  35.86 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  35.86 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  34.92 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  35.12 
 
 
211 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  37.75 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.48 
 
 
193 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  37.63 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  37.13 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.62 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  38 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  40.46 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.69 
 
 
183 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.01 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.68 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.04 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 
194 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.51 
 
 
209 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  34 
 
 
211 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  34.39 
 
 
217 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  38.74 
 
 
197 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  34.04 
 
 
216 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 
184 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  38.73 
 
 
188 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.5 
 
 
209 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  40.43 
 
 
185 aa  104  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  40.43 
 
 
185 aa  104  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.22 
 
 
196 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  33.16 
 
 
183 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.92 
 
 
183 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  37.58 
 
 
193 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.92 
 
 
183 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  34.5 
 
 
183 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.92 
 
 
183 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.96 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.96 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.09 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.15 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.04 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  31.58 
 
 
213 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.69 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.59 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.54 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  32.06 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  32.04 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  30.67 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  43.82 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  32.99 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  28.74 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  31.03 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  29.56 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.46 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  31.41 
 
 
213 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.06 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  38.14 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  37.6 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  30.1 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  28.57 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  34.27 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  32.31 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  32.56 
 
 
225 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  26.53 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  32.34 
 
 
221 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.23 
 
 
233 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>