More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3932 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3932  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0546  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.24 
 
 		 226 aa  315  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0229  two component transcriptional regulator  73.76 
 
 		 227 aa  311  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0612  two component transcriptional regulator  72.85 
 
 		 227 aa  308  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  47.95 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  46.12 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  45.21 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  45.21 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 255 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  44.09 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  44.75 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  45.21 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  43.38 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  44.29 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  47 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.38 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.12 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  42.01 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  42.01 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 235 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.01 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.01 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  44.14 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.15 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 234 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 248 aa  181  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0990  transcriptional regulator  42.92 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  44.29 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  43.84 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  42.41 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  42.79 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  43.38 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>