125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0094 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0094  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
342 aa  697  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1878  cell wall hydrolase/autolysin  44.19 
 
 
380 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0023458  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 
236 aa  61.6  2e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1374  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.08 
 
 
529 aa  57.8  2e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.736006  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
364 aa  57.4  3e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.779123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1162  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.95 
 
 
233 aa  56.2  7e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.820741  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1194  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.3 
 
 
291 aa  56.2  8e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1804  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 
240 aa  55.8  9e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0142  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.34 
 
 
603 aa  55.8  1e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.454848 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06421  cell wall hydrolase/autolysin  29.41 
 
 
361 aa  54.7  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10331  cell wall hydrolase/autolysin  30.11 
 
 
362 aa  54.7  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  normal  0.548996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4521  cell wall hydrolase/autolysin  24.21 
 
 
318 aa  55.1  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1689  cell wall hydrolase/autolysin  27.95 
 
 
291 aa  54.3  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.147048  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1722  cell wall hydrolase/autolysin  27.95 
 
 
291 aa  54.3  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06721  cell wall hydrolase/autolysin  29.41 
 
 
361 aa  53.9  4e-06  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.347132  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06811  cell wall hydrolase/autolysin  29.07 
 
 
364 aa  53.5  5e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.197381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.36 
 
 
344 aa  52.8  8e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  23.88 
 
 
240 aa  52.8  1e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4010  cell wall hydrolase/autolysin  32.96 
 
 
254 aa  52  1e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1534  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.27 
 
 
562 aa  52  1e-05  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0577934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0671  cell wall hydrolase/autolysin  31.28 
 
 
320 aa  52.4  1e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18931  cell wall hydrolase/autolysin  30 
 
 
396 aa  52.4  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.98 
 
 
474 aa  52.4  1e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3260  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.31 
 
 
417 aa  52.4  1e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1398  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  25.13 
 
 
241 aa  52  1e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  26.63 
 
 
352 aa  51.6  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  6.34005e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0926  cell wall hydrolase/autolysin  26.29 
 
 
219 aa  52  2e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2816  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  28.85 
 
 
289 aa  51.6  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2710  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  28.85 
 
 
289 aa  51.6  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  25.11 
 
 
627 aa  51.6  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.55726e-05  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  25 
 
 
451 aa  51.2  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.53724e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2595  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  28.85 
 
 
289 aa  51.6  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2686  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  28.85 
 
 
289 aa  51.6  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148048  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3223  cell wall hydrolase/autolysin  25.11 
 
 
257 aa  51.2  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2644  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  28.85 
 
 
289 aa  51.6  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2832  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.64 
 
 
644 aa  51.6  2e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.47 
 
 
746 aa  50.8  3e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0265  cell wall hydrolase/autolysin  27.92 
 
 
271 aa  50.4  4e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4394  cell wall hydrolase/autolysin  29.21 
 
 
296 aa  50.4  5e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.41 
 
 
706 aa  50.1  5e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.89 
 
 
242 aa  49.7  7e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  3.05091e-06 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.55 
 
 
317 aa  49.7  7e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.344171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.27 
 
 
190 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.72144e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2721  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  27.4 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3665  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  27.4 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.353577  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.9 
 
 
619 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2590  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  27.4 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2807  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  27.4 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9001  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  28.96 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0053  cell wall hydrolase/autolysin  26.7 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3463  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  26.17 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2134  cell wall hydrolase/autolysin  26.72 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.373316  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06741  cell wall hydrolase/autolysin  26.44 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142598  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2572  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  27.4 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.09 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2997  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.21 
 
 
789 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1226  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.4 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.84 
 
 
623 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1244  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  27.4 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02335  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  27.4 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02297  hypothetical protein  27.4 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0892  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.38 
 
 
568 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.105159  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1381  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.57 
 
 
443 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3352  cell wall hydrolase/autolysin  30.06 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.939997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.7 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2909  cell wall hydrolase/autolysin  25.7 
 
 
227 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3140  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  26.15 
 
 
419 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0616  cell wall hydrolase/autolysin  28.82 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.75 
 
 
338 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2956  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  26.92 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.702155  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_002950  PG1048  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.35 
 
 
396 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0290  cell wall hydrolase/autolysin  32.28 
 
 
283 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.75 
 
 
338 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  5.34753e-06  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.26 
 
 
619 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.41 
 
 
657 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.37238e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.54 
 
 
435 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0071  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.87 
 
 
238 aa  46.2  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.57753e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.19 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3384  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.87 
 
 
414 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.25517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.5 
 
 
440 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0113  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  23.6 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.8 
 
 
631 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  1.95536e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1654  cell wall hydrolase/autolysin  25.14 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2753  cell wall hydrolase/autolysin  32.03 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.984252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.09 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00703451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.57 
 
 
504 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1952  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.57 
 
 
503 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.17 
 
 
471 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3402  cell wall hydrolase/autolysin  26.91 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.62 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2611  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.64 
 
 
505 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.86 
 
 
657 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  21.1 
 
 
1805 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2576  cell wall hydrolase/autolysin  24.6 
 
 
240 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.88208e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2573  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.5 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.97 
 
 
604 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00690488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1064  cell wall hydrolase/autolysin  26.56 
 
 
227 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3053  cell wall hydrolase/autolysin  23.86 
 
 
591 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0425538  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0920  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.11 
 
 
414 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3067  cell wall hydrolase/autolysin  23.86 
 
 
591 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>