More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0069 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  54.2 
 
 
965 aa  974  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.92 
 
 
939 aa  639  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  53.25 
 
 
972 aa  958  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  100 
 
 
953 aa  1946  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  53.56 
 
 
936 aa  902  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  40.1 
 
 
903 aa  631  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  40 
 
 
903 aa  624  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.44 
 
 
928 aa  615  1e-174  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.98 
 
 
930 aa  611  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  39.08 
 
 
903 aa  612  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.14 
 
 
926 aa  606  1e-172  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  41.05 
 
 
924 aa  603  1e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  37.38 
 
 
930 aa  602  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.35 
 
 
903 aa  601  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.85 
 
 
951 aa  597  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  39.45 
 
 
912 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  40.15 
 
 
931 aa  594  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  38.98 
 
 
926 aa  593  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.88 
 
 
891 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.08203e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  38.56 
 
 
891 aa  592  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.31 
 
 
932 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.03572e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.41 
 
 
892 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.2 
 
 
932 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.31 
 
 
932 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  36.29 
 
 
982 aa  588  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  37.32 
 
 
956 aa  588  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.72 
 
 
892 aa  589  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  38.78 
 
 
940 aa  588  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  39.6 
 
 
908 aa  588  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  37.57 
 
 
932 aa  588  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  38.45 
 
 
938 aa  584  1e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.86 
 
 
892 aa  583  1e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33536e-24 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.02 
 
 
934 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.8353e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  39.54 
 
 
926 aa  582  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.18 
 
 
892 aa  582  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  38.18 
 
 
933 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  8.22051e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  38.45 
 
 
923 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.36 
 
 
892 aa  581  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  4.31166e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  37.23 
 
 
928 aa  576  1e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.7 
 
 
888 aa  578  1e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.12 
 
 
893 aa  577  1e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  38.74 
 
 
926 aa  577  1e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  38.24 
 
 
941 aa  576  1e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  38.74 
 
 
926 aa  577  1e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  38.74 
 
 
926 aa  577  1e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  36.73 
 
 
903 aa  577  1e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  38.74 
 
 
926 aa  577  1e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  37.7 
 
 
929 aa  575  1e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  37.37 
 
 
937 aa  572  1e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  39.01 
 
 
923 aa  575  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  37.38 
 
 
935 aa  574  1e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37.43 
 
 
931 aa  572  1e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  38.52 
 
 
906 aa  575  1e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  38.24 
 
 
934 aa  573  1e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  3.12634e-06  hitchhiker  1.5928e-06 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  37.84 
 
 
928 aa  575  1e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  39.01 
 
 
923 aa  575  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  39.44 
 
 
913 aa  575  1e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  37.47 
 
 
937 aa  574  1e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  39.01 
 
 
923 aa  574  1e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  37.85 
 
 
915 aa  572  1e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  38.65 
 
 
930 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  37.43 
 
 
893 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  37.8 
 
 
893 aa  569  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  37.85 
 
 
937 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  37.53 
 
 
946 aa  571  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  37.45 
 
 
929 aa  571  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  37.69 
 
 
939 aa  571  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  38.91 
 
 
924 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  37.75 
 
 
937 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38 
 
 
934 aa  571  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  38.15 
 
 
907 aa  572  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  39 
 
 
917 aa  572  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  37.35 
 
 
939 aa  571  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  37.71 
 
 
1000 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  37.61 
 
 
946 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  36.72 
 
 
945 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  9.34143e-07 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  35.08 
 
 
949 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  37.92 
 
 
921 aa  563  1e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  9.15793e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  37.92 
 
 
921 aa  562  1e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.5151e-06  hitchhiker  5.6057e-08 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  37.78 
 
 
937 aa  563  1e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  37.01 
 
 
928 aa  563  1e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  37.09 
 
 
934 aa  564  1e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  38.37 
 
 
929 aa  565  1e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  37.92 
 
 
921 aa  563  1e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  38.21 
 
 
953 aa  564  1e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  37.92 
 
 
935 aa  563  1e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.90678e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.37 
 
 
928 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  36.59 
 
 
982 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  36.86 
 
 
979 aa  562  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  36.51 
 
 
877 aa  561  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  38.1 
 
 
937 aa  561  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.37 
 
 
928 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  3.30989e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  37.05 
 
 
939 aa  559  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.37 
 
 
928 aa  561  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.70331e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  37.28 
 
 
918 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  38.06 
 
 
943 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  38.06 
 
 
933 aa  561  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.37 
 
 
928 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.13441e-05  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.37 
 
 
928 aa  561  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.47993e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  38.37 
 
 
928 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>