85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0047 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  100 
 
 		 425 aa  864    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  40.16 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  40.41 
 
 		 398 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  38.8 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  40.05 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  38.54 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  38.28 
 
 		 406 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  37.31 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  37.31 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  37.31 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  37.31 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  37.31 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  37.31 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  37.31 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  37.31 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  37.31 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  37.82 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  38.29 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  37.31 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  37.4 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  37.4 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  37.4 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  37.4 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  37.4 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  32.31 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  31.4 
 
 		 393 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  33.7 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  29.9 
 
 		 398 aa  166  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  29.71 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  27.3 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  29.37 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  25.61 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  25.34 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  26.89 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  28.84 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  28.62 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  27.11 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  26.38 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  29.46 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  28.32 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  28.32 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  28.32 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  27.62 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  26.36 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  26.22 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  26.79 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  26.28 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  26.23 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  25.76 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  24.14 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  26.93 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  24.11 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  24.21 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  23.42 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  25.61 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  22.76 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  23.87 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  22.83 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  33.33 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  22.83 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  22.65 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  25.81 
 
 		 409 aa  67  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  21.71 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  21.96 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  22.45 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  24.02 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  29.41 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  21.83 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  26.47 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  22.54 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  26.47 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  28.75 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  28.75 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  23.83 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  28.75 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  28.75 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  25.56 
 
 		 511 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  33.57 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  24.29 
 
 		 641 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  25.56 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  27.93 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  21.93 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  24.81 
 
 		 511 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  23.26 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  19.42 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>