51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0071 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  100 
 
 		 86 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  56.25 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  40.96 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  50 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  41.98 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  35.8 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  39.24 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  35.14 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  33.33 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  36.49 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  36 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  36.25 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  32.88 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  36.25 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  36.25 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  36.25 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  36.71 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  35.53 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  36.49 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  34.21 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  33.78 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  34.18 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  28.21 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  28.92 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  28.57 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.1 
 
 		 384 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  32.1 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  28 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  32.5 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  28.57 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  28.38 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  28.75 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  33.9 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  32.2 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  27.03 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.75 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  37.1 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  32.2 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  28.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  43.4 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  35.9 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  23.08 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  30.16 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  30.16 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>