More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2339 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
373 aa  767    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
399 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 
366 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
378 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
389 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.79 
 
 
371 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.87 
 
 
372 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 
365 aa  126  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
381 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
398 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  28.46 
 
 
370 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
388 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.05 
 
 
365 aa  124  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.04 
 
 
395 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
398 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.79 
 
 
373 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
387 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  28.18 
 
 
362 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.84 
 
 
745 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.61 
 
 
363 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
371 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
376 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.87 
 
 
369 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
381 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
384 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
381 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
356 aa  113  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
378 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
371 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
406 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
391 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
370 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
387 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
369 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
403 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
380 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
403 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
371 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
383 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  28.43 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
395 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
439 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
386 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
374 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  30.04 
 
 
371 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
382 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
373 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
421 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
394 aa  106  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
369 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
379 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
374 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
361 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
373 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
379 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
424 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
369 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1139  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
366 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0404734  normal  0.023827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
379 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
379 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
375 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
387 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
368 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  38.98 
 
 
398 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
378 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
366 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>