97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2782 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 		 256 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  65.38 
 
 		 264 aa  331  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  58.4 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  47.13 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  51.45 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  47.86 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  45.24 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  50.41 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  41.27 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  50.41 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  49.59 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  39.76 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  38.46 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  33.46 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  34.11 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  27.24 
 
 		 307 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  32.33 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  32.28 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  30.83 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  27.38 
 
 		 293 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  27.13 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  26.26 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  26.2 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  30 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  29.8 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  28.02 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  25.56 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  31.4 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.8 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  28.38 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  28.97 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.87 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  32.8 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.8 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  32.8 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  26.25 
 
 		 392 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.75 
 
 		 335 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  33.16 
 
 		 376 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.55 
 
 		 362 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  32.8 
 
 		 374 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  24.46 
 
 		 414 aa  52  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  28.86 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.92 
 
 		 419 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  31.42 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  32.99 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  30.32 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  30.92 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  23.81 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 353 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  30.89 
 
 		 353 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  25.51 
 
 		 333 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.09 
 
 		 354 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  27.75 
 
 		 358 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.27 
 
 		 376 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  32.45 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  29.69 
 
 		 292 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  28.27 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.89 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  28.57 
 
 		 363 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  32.39 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.57 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  30.65 
 
 		 376 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  30.34 
 
 		 388 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  28.12 
 
 		 335 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  31.22 
 
 		 374 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  27.75 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.16 
 
 		 393 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 353 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  24.62 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  32.8 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  27.2 
 
 		 362 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  27.71 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.26 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  24.25 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  31.18 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  28.71 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.42 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  30.65 
 
 		 380 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  24.66 
 
 		 361 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  31.78 
 
 		 360 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  30.11 
 
 		 362 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  28.3 
 
 		 344 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  24.03 
 
 		 330 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  30.09 
 
 		 344 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  28.12 
 
 		 403 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>