57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1110 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 359 aa  736    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  68.86 
 
 		 359 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  65.34 
 
 		 354 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  67.43 
 
 		 358 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  65.45 
 
 		 370 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  65.45 
 
 		 370 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  65.17 
 
 		 370 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  61.32 
 
 		 354 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  61.6 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  60.46 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  61.3 
 
 		 355 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  61.78 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  45.43 
 
 		 350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  40.83 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  27.7 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  28.78 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  27.71 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  28.27 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  28.42 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  28.42 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  28.83 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  28.42 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  28.42 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  28.83 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  28.06 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  28.06 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  28.06 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  27.7 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  25.85 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  25.49 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  21.08 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  24.18 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  22.25 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  23.27 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  25.09 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  25.64 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  20.35 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  23.47 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  23.78 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  21.83 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  23.66 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  17.28 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  25.34 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  25.22 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  24.6 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>